Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXF7

DCAF16, DDB1- and CUL4-associated factor 16, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF16Q9NXF7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
DCAF16Q9NXF7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DCAF16Q9NXF7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DCAF16Q9NXF7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF16Q9NXF7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DCAF16Q9NXF7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCAF16Q9NXF7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DCAF16Q9NXF7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DCAF16Q9NXF7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DCAF16Q9NXF7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DCAF16Q9NXF7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCAF16Q9NXF7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCAF16Q9NXF7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF16Q9NXF7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCAF16Q9NXF7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF16Q9NXF7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF16Q9NXF7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCAF16Q9NXF7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCAF16Q9NXF7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCAF16Q9NXF7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCAF16Q9NXF7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms