Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU7

SDAD1, Protein SDA1 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDAD1Q9NVU7 YARS-208ENST00000487404 2197 ntTSL 211.89□□□□□ -0.517e-10■■■■■ 61.7
SDAD1Q9NVU7 YARS-203ENST00000469100 2247 ntTSL 210.96□□□□□ -0.667e-10■■■■■ 61.7
SDAD1Q9NVU7 YARS-206ENST00000478828 1044 ntTSL 210.33□□□□□ -0.767e-10■■■■■ 61.7
SDAD1Q9NVU7 YARS-210ENST00000616261 1167 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.067e-10■■■■■ 61.7
SDAD1Q9NVU7 WDR48-201ENST00000302313 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.163e-10■■■■■ 61.3
SDAD1Q9NVU7 WDR48-204ENST00000423296 563 ntTSL 46.6□□□□□ -1.353e-10■■■■■ 61.3
SDAD1Q9NVU7 WDR48-203ENST00000420940 3772 ntTSL 1 (best)6□□□□□ -1.453e-10■■■■■ 61.3
SDAD1Q9NVU7 WDR48-202ENST00000413099 2300 ntTSL 25.98□□□□□ -1.453e-10■■■■■ 61.3
SDAD1Q9NVU7 WDR48-205ENST00000433841 645 ntTSL 32.45□□□□□ -2.023e-10■■■■■ 61.3
SDAD1Q9NVU7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.72■■□□□ 1.391e-8■■■■■ 60.5
SDAD1Q9NVU7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 60.5
SDAD1Q9NVU7 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.011e-8■■■■■ 60.5
SDAD1Q9NVU7 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.161e-8■■■■■ 60.5
SDAD1Q9NVU7 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.161e-8■■■■■ 60.5
SDAD1Q9NVU7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.054e-7■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.994e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 ESRRA-206ENST00000539594 747 ntTSL 326.1■■□□□ 1.774e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.664e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.295e-8■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.24e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 SH3D21-202ENST00000474766 2043 ntTSL 1 (best)22.24■■□□□ 1.154e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 NAPB-206ENST00000487502 699 ntTSL 221.89■■□□□ 1.094e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.074e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.064e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.054e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.054e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-217ENST00000526786 1246 ntTSL 221.36■■□□□ 1.014e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-241ENST00000531931 614 ntTSL 321.36■■□□□ 1.014e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 14e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 MIR663AHG-223ENST00000601079 613 ntTSL 521.18■□□□□ 0.982e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.974e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 MIR663AHG-228ENST00000608487 486 ntTSL 521.09■□□□□ 0.974e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.974e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 MIR663AHG-222ENST00000600263 751 ntTSL 521.09■□□□□ 0.974e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 PPP1R12C-209ENST00000592993 2269 ntTSL 1 (best)20.89■□□□□ 0.945e-8■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-212ENST00000525695 907 ntTSL 520.87■□□□□ 0.934e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.924e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.894e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 MIR663AHG-206ENST00000594150 693 ntTSL 520.56■□□□□ 0.884e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.884e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 NAPB-204ENST00000468128 782 ntTSL 520.42■□□□□ 0.864e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 FARSA-203ENST00000586146 1707 ntTSL 520.37■□□□□ 0.854e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.844e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 ST20-MTHFS-202ENST00000494999 632 ntTSL 320.21■□□□□ 0.834e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.782e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 MIR663AHG-216ENST00000597979 568 ntTSL 519.76■□□□□ 0.754e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-216ENST00000526710 996 ntTSL 219.25■□□□□ 0.674e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 GRN-221ENST00000593167 763 ntTSL 519.15■□□□□ 0.669e-14■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 FARSA-208ENST00000588965 1831 ntTSL 519.05■□□□□ 0.644e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 PKD1-235ENST00000568591 2545 ntTSL 219.04■□□□□ 0.644e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 PKD1-221ENST00000488185 737 ntTSL 518.98■□□□□ 0.634e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.625e-8■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.614e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 PKD1-230ENST00000565639 1976 ntTSL 518.73■□□□□ 0.594e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.564e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.564e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 MIR663AHG-236ENST00000610014 475 ntTSL 518.51■□□□□ 0.554e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.43■□□□□ 0.544e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.514e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 UBXN2A-203ENST00000446425 2195 ntTSL 1 (best)18.17■□□□□ 0.54e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.464e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 DGCR2-203ENST00000467659 2459 ntTSL 517.9■□□□□ 0.464e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 AHNAK-208ENST00000533365 584 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.9■□□□□ 0.464e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-235ENST00000530848 688 ntTSL 317.88■□□□□ 0.454e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 PPP6R2-206ENST00000427222 1811 ntTSL 517.42■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 SH3D21-203ENST00000480549 3182 ntTSL 217.39■□□□□ 0.374e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 FARSA-210ENST00000593021 1135 ntTSL 517.33■□□□□ 0.364e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.314e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.294e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.234e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-249ENST00000533749 633 ntTSL 516.47■□□□□ 0.234e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.194e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.174e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-224ENST00000529007 861 ntTSL 216.09■□□□□ 0.174e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-206ENST00000524397 957 ntTSL 316.09■□□□□ 0.174e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-237ENST00000531281 813 ntTSL 215.9■□□□□ 0.144e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.124e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-250ENST00000533833 831 ntTSL 515.65■□□□□ 0.14e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 MIR663AHG-205ENST00000594135 654 ntTSL 515.61■□□□□ 0.094e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 MIR663AHG-235ENST00000609914 644 ntTSL 515.61■□□□□ 0.094e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.094e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 PPP1R12C-207ENST00000591938 1262 ntTSL 515.58■□□□□ 0.084e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 SREBF2-202ENST00000424354 5699 ntTSL 1 (best)15.48■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 DGCR2-202ENST00000389262 4814 ntTSL 1 (best)15.46■□□□□ 0.074e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.035e-7■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.019e-14■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -05e-7■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -04e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-244ENST00000532543 791 ntTSL 314.96□□□□□ -0.014e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 MIR663AHG-217ENST00000598150 751 ntTSL 514.87□□□□□ -0.034e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.059e-14■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.064e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 GRN-209ENST00000587518 526 ntTSL 414.46□□□□□ -0.099e-14■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 GRN-220ENST00000592783 541 ntTSL 414.43□□□□□ -0.19e-14■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.12e-6■■■■■ 58.9
SDAD1Q9NVU7 EEF1D-230ENST00000530191 853 ntTSL 314.41□□□□□ -0.14e-6■■■■■ 58.9
Retrieved 100 of 11,671 protein–RNA pairs in 235.6 ms