RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440177.6

ERF-202, Transcript of ETS2 repressor factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ERF, Length 2,032 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERF-202ENST00000440177 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.24■■■■■ 4.99
ERF-202ENST00000440177 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.15■■■■■ 4.02
ERF-202ENST00000440177 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.87■■■■□ 3.81
ERF-202ENST00000440177 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.24■■■■□ 3.71
ERF-202ENST00000440177 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.19■■■■□ 3.7
ERF-202ENST00000440177 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.86■■■■□ 3.65
ERF-202ENST00000440177 ABCC9O60706 1549 aa37.84■■■■□ 3.65
ERF-202ENST00000440177 MYO15BQ96JP2 1530 aa37.73■■■■□ 3.63
ERF-202ENST00000440177 NACADO15069 1562 aa37.41■■■■□ 3.58
ERF-202ENST00000440177 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.02■■■■□ 3.52
ERF-202ENST00000440177 SCRIBQ14160 1630 aa36.96■■■■□ 3.51
ERF-202ENST00000440177 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.58■■■■□ 3.45
ERF-202ENST00000440177 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.2■■■■□ 3.39
ERF-202ENST00000440177 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
ERF-202ENST00000440177 CECR2Q9BXF3 1484 aa35.92■■■■□ 3.34
ERF-202ENST00000440177 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.89■■■■□ 3.34
ERF-202ENST00000440177 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.78■■■■□ 3.32
ERF-202ENST00000440177 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.72■■■■□ 3.31
ERF-202ENST00000440177 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.67■■■■□ 3.3
ERF-202ENST00000440177 SMARCA4P51532 1647 aa35.46■■■■□ 3.27
ERF-202ENST00000440177 WIZO95785 1651 aa35.4■■■■□ 3.26
ERF-202ENST00000440177 CHIC1Q5VXU3 224 aa35.15■■■■□ 3.22
ERF-202ENST00000440177 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
ERF-202ENST00000440177 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.05■■■■□ 3.2
ERF-202ENST00000440177 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa34.88■■■■□ 3.17
ERF-202ENST00000440177 SMARCA2P51531 1590 aa34.85■■■■□ 3.17
ERF-202ENST00000440177 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
ERF-202ENST00000440177 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.75■■■■□ 3.15
ERF-202ENST00000440177 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
ERF-202ENST00000440177 NCAPD3P42695 1498 aa34.57■■■■□ 3.12
ERF-202ENST00000440177 HMGXB3Q12766 1538 aa34.49■■■■□ 3.11
ERF-202ENST00000440177 TRIM41Q8WV44 630 aa34.4■■■■□ 3.1
ERF-202ENST00000440177 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.23■■■■□ 3.07
ERF-202ENST00000440177 ABCC8Q09428 1581 aa34.03■■■■□ 3.04
ERF-202ENST00000440177 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.94■■■■□ 3.02
ERF-202ENST00000440177 CFTRP13569 1480 aa33.85■■■■□ 3.01
ERF-202ENST00000440177 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.85■■■■□ 3.01
ERF-202ENST00000440177 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.81■■■■□ 3
ERF-202ENST00000440177 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
ERF-202ENST00000440177 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.71■■■□□ 2.99
ERF-202ENST00000440177 SYNJ1O43426 1573 aa33.64■■■□□ 2.97
ERF-202ENST00000440177 PRDM2Q13029 1718 aa33.55■■■□□ 2.96
ERF-202ENST00000440177 TOP2BQ02880 1626 aa33.51■■■□□ 2.95
ERF-202ENST00000440177 SOGA1O94964 1423 aa33.5■■■□□ 2.95
ERF-202ENST00000440177 EEA1Q15075 1411 aa33.5■■■□□ 2.95
ERF-202ENST00000440177 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.45■■■□□ 2.94
ERF-202ENST00000440177 CUX1P39880 1505 aa33.38■■■□□ 2.93
ERF-202ENST00000440177 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.34■■■□□ 2.93
ERF-202ENST00000440177 CSRNP3Q8WYN3 585 aa33.33■■■□□ 2.93
ERF-202ENST00000440177 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.3■■■□□ 2.92
ERF-202ENST00000440177 FANCD2Q9BXW9 1451 aa33.3■■■□□ 2.92
ERF-202ENST00000440177 NESP48681 1621 aa33.28■■■□□ 2.92
ERF-202ENST00000440177 EHMT2Q96KQ7 1210 aa33.23■■■□□ 2.91
ERF-202ENST00000440177 PDS5BQ9NTI5 1447 aa33.1■■■□□ 2.89
ERF-202ENST00000440177 CEP164Q9UPV0 1460 aa33.05■■■□□ 2.88
ERF-202ENST00000440177 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.01■■■□□ 2.87
ERF-202ENST00000440177 GOLGA3Q08378 1498 aa33■■■□□ 2.87
ERF-202ENST00000440177 TNIKQ9UKE5 1360 aa32.99■■■□□ 2.87
ERF-202ENST00000440177 KIF27Q86VH2 1401 aa32.99■■■□□ 2.87
ERF-202ENST00000440177 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.99■■■□□ 2.87
ERF-202ENST00000440177 KIF21BO75037 1637 aa32.98■■■□□ 2.87
ERF-202ENST00000440177 TOPBP1Q92547 1522 aa32.95■■■□□ 2.86
ERF-202ENST00000440177 UBTFP17480 764 aaKnown RBP32.91■■■□□ 2.86
ERF-202ENST00000440177 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
ERF-202ENST00000440177 CUX2O14529 1486 aa32.82■■■□□ 2.85
ERF-202ENST00000440177 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.82■■■□□ 2.84
ERF-202ENST00000440177 PRXQ9BXM0 1461 aa32.81■■■□□ 2.84
ERF-202ENST00000440177 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP32.81■■■□□ 2.84
ERF-202ENST00000440177 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa32.79■■■□□ 2.84
ERF-202ENST00000440177 CEP162Q5TB80 1403 aa32.78■■■□□ 2.84
ERF-202ENST00000440177 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.74■■■□□ 2.83
ERF-202ENST00000440177 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa32.72■■■□□ 2.83
ERF-202ENST00000440177 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa32.71■■■□□ 2.83
ERF-202ENST00000440177 IGF1RP08069 1367 aa32.71■■■□□ 2.83
ERF-202ENST00000440177 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.62■■■□□ 2.81
ERF-202ENST00000440177 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.54■■■□□ 2.8
ERF-202ENST00000440177 WDR97A6NE52 1622 aa32.5■■■□□ 2.79
ERF-202ENST00000440177 CLIP1P30622 1438 aa32.5■■■□□ 2.79
ERF-202ENST00000440177 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.46■■■□□ 2.79
ERF-202ENST00000440177 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP32.45■■■□□ 2.79
ERF-202ENST00000440177 ERCC6Q03468 1493 aa32.43■■■□□ 2.78
ERF-202ENST00000440177 WDR62O43379 1518 aa32.42■■■□□ 2.78
ERF-202ENST00000440177 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP32.42■■■□□ 2.78
ERF-202ENST00000440177 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
ERF-202ENST00000440177 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.38■■■□□ 2.77
ERF-202ENST00000440177 GAPVD1Q14C86 1478 aa32.37■■■□□ 2.77
ERF-202ENST00000440177 CUL7Q14999 1698 aa32.33■■■□□ 2.77
ERF-202ENST00000440177 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
ERF-202ENST00000440177 IFT140Q96RY7 1462 aa32.27■■■□□ 2.76
ERF-202ENST00000440177 VPS8Q8N3P4 1428 aa32.25■■■□□ 2.75
ERF-202ENST00000440177 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
ERF-202ENST00000440177 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.17■■■□□ 2.74
ERF-202ENST00000440177 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP32.15■■■□□ 2.742e-11■■■■■ 57.8
ERF-202ENST00000440177 ARAP1Q96P48 1450 aa32.12■■■□□ 2.73
ERF-202ENST00000440177 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa32.1■■■□□ 2.73
ERF-202ENST00000440177 GRIN2BQ13224 1484 aa32.08■■■□□ 2.73
ERF-202ENST00000440177 PBRM1Q86U86 1689 aa32.07■■■□□ 2.72
ERF-202ENST00000440177 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
ERF-202ENST00000440177 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.03■■■□□ 2.72
ERF-202ENST00000440177 APLP2Q06481 763 aa31.99■■■□□ 2.71
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