Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO6Q9NRD1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO6Q9NRD1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FBXO6Q9NRD1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO6Q9NRD1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO6Q9NRD1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO6Q9NRD1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO6Q9NRD1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO6Q9NRD1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO6Q9NRD1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO6Q9NRD1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO6Q9NRD1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO6Q9NRD1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FBXO6Q9NRD1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO6Q9NRD1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO6Q9NRD1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FBXO6Q9NRD1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FBXO6Q9NRD1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO6Q9NRD1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO6Q9NRD1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FBXO6Q9NRD1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
FBXO6Q9NRD1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FBXO6Q9NRD1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FBXO6Q9NRD1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FBXO6Q9NRD1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FBXO6Q9NRD1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXO6Q9NRD1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXO6Q9NRD1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FBXO6Q9NRD1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FBXO6Q9NRD1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FBXO6Q9NRD1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
FBXO6Q9NRD1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FBXO6Q9NRD1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXO6Q9NRD1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FBXO6Q9NRD1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FBXO6Q9NRD1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FBXO6Q9NRD1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FBXO6Q9NRD1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FBXO6Q9NRD1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FBXO6Q9NRD1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FBXO6Q9NRD1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXO6Q9NRD1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FBXO6Q9NRD1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FBXO6Q9NRD1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FBXO6Q9NRD1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FBXO6Q9NRD1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO6Q9NRD1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO6Q9NRD1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO6Q9NRD1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO6Q9NRD1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FBXO6Q9NRD1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FBXO6Q9NRD1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO6Q9NRD1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FBXO6Q9NRD1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FBXO6Q9NRD1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FBXO6Q9NRD1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FBXO6Q9NRD1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FBXO6Q9NRD1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FBXO6Q9NRD1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO6Q9NRD1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO6Q9NRD1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FBXO6Q9NRD1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO6Q9NRD1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO6Q9NRD1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO6Q9NRD1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO6Q9NRD1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO6Q9NRD1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO6Q9NRD1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO6Q9NRD1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXO6Q9NRD1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXO6Q9NRD1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXO6Q9NRD1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO6Q9NRD1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FBXO6Q9NRD1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO6Q9NRD1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO6Q9NRD1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO6Q9NRD1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO6Q9NRD1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO6Q9NRD1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO6Q9NRD1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO6Q9NRD1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO6Q9NRD1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO6Q9NRD1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO6Q9NRD1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO6Q9NRD1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO6Q9NRD1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO6Q9NRD1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO6Q9NRD1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO6Q9NRD1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO6Q9NRD1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
FBXO6Q9NRD1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO6Q9NRD1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FBXO6Q9NRD1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXO6Q9NRD1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FBXO6Q9NRD1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FBXO6Q9NRD1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FBXO6Q9NRD1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
FBXO6Q9NRD1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO6Q9NRD1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FBXO6Q9NRD1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms