Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA2

MMP25, Matrix metalloproteinase-25, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP25Q9NPA2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MMP25Q9NPA2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP25Q9NPA2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MMP25Q9NPA2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP25Q9NPA2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP25Q9NPA2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP25Q9NPA2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP25Q9NPA2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP25Q9NPA2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP25Q9NPA2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP25Q9NPA2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP25Q9NPA2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP25Q9NPA2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP25Q9NPA2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP25Q9NPA2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP25Q9NPA2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP25Q9NPA2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP25Q9NPA2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP25Q9NPA2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP25Q9NPA2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MMP25Q9NPA2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP25Q9NPA2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP25Q9NPA2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MMP25Q9NPA2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP25Q9NPA2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP25Q9NPA2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP25Q9NPA2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP25Q9NPA2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP25Q9NPA2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MMP25Q9NPA2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MMP25Q9NPA2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP25Q9NPA2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP25Q9NPA2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MMP25Q9NPA2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MMP25Q9NPA2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MMP25Q9NPA2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MMP25Q9NPA2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP25Q9NPA2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MMP25Q9NPA2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP25Q9NPA2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MMP25Q9NPA2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP25Q9NPA2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MMP25Q9NPA2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MMP25Q9NPA2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MMP25Q9NPA2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MMP25Q9NPA2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MMP25Q9NPA2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP25Q9NPA2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MMP25Q9NPA2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MMP25Q9NPA2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP25Q9NPA2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP25Q9NPA2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP25Q9NPA2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MMP25Q9NPA2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MMP25Q9NPA2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MMP25Q9NPA2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MMP25Q9NPA2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MMP25Q9NPA2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP25Q9NPA2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MMP25Q9NPA2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP25Q9NPA2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP25Q9NPA2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MMP25Q9NPA2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MMP25Q9NPA2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP25Q9NPA2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP25Q9NPA2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP25Q9NPA2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP25Q9NPA2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP25Q9NPA2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MMP25Q9NPA2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP25Q9NPA2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP25Q9NPA2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MMP25Q9NPA2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP25Q9NPA2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP25Q9NPA2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MMP25Q9NPA2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MMP25Q9NPA2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MMP25Q9NPA2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MMP25Q9NPA2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP25Q9NPA2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MMP25Q9NPA2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MMP25Q9NPA2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP25Q9NPA2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP25Q9NPA2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP25Q9NPA2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MMP25Q9NPA2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP25Q9NPA2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP25Q9NPA2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP25Q9NPA2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP25Q9NPA2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MMP25Q9NPA2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP25Q9NPA2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP25Q9NPA2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MMP25Q9NPA2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP25Q9NPA2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP25Q9NPA2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP25Q9NPA2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MMP25Q9NPA2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP25Q9NPA2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MMP25Q9NPA2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms