Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPA2

MMP25, Matrix metalloproteinase-25, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP25Q9NPA2 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
MMP25Q9NPA2 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
MMP25Q9NPA2 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
MMP25Q9NPA2 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
MMP25Q9NPA2 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
MMP25Q9NPA2 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
MMP25Q9NPA2 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
MMP25Q9NPA2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
MMP25Q9NPA2 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
MMP25Q9NPA2 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
MMP25Q9NPA2 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MMP25Q9NPA2 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MMP25Q9NPA2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MMP25Q9NPA2 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MMP25Q9NPA2 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
MMP25Q9NPA2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
MMP25Q9NPA2 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
MMP25Q9NPA2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
MMP25Q9NPA2 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
MMP25Q9NPA2 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
MMP25Q9NPA2 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
MMP25Q9NPA2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MMP25Q9NPA2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MMP25Q9NPA2 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MMP25Q9NPA2 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
MMP25Q9NPA2 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MMP25Q9NPA2 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MMP25Q9NPA2 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
MMP25Q9NPA2 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MMP25Q9NPA2 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MMP25Q9NPA2 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MMP25Q9NPA2 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP25Q9NPA2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP25Q9NPA2 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MMP25Q9NPA2 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MMP25Q9NPA2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MMP25Q9NPA2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MMP25Q9NPA2 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MMP25Q9NPA2 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MMP25Q9NPA2 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MMP25Q9NPA2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MMP25Q9NPA2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MMP25Q9NPA2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MMP25Q9NPA2 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MMP25Q9NPA2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MMP25Q9NPA2 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MMP25Q9NPA2 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MMP25Q9NPA2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP25Q9NPA2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP25Q9NPA2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP25Q9NPA2 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MMP25Q9NPA2 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MMP25Q9NPA2 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
MMP25Q9NPA2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MMP25Q9NPA2 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
MMP25Q9NPA2 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
MMP25Q9NPA2 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP25Q9NPA2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP25Q9NPA2 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
MMP25Q9NPA2 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP25Q9NPA2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP25Q9NPA2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MMP25Q9NPA2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP25Q9NPA2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP25Q9NPA2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP25Q9NPA2 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP25Q9NPA2 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP25Q9NPA2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP25Q9NPA2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP25Q9NPA2 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP25Q9NPA2 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
MMP25Q9NPA2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP25Q9NPA2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP25Q9NPA2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MMP25Q9NPA2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MMP25Q9NPA2 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP25Q9NPA2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP25Q9NPA2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP25Q9NPA2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP25Q9NPA2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP25Q9NPA2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP25Q9NPA2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP25Q9NPA2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP25Q9NPA2 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP25Q9NPA2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP25Q9NPA2 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP25Q9NPA2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMP25Q9NPA2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MMP25Q9NPA2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MMP25Q9NPA2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP25Q9NPA2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMP25Q9NPA2 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MMP25Q9NPA2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP25Q9NPA2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP25Q9NPA2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP25Q9NPA2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP25Q9NPA2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP25Q9NPA2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP25Q9NPA2 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP25Q9NPA2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms