Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB96

FANCE, Fanconi anemia group E protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCEQ9HB96 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FANCEQ9HB96 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FANCEQ9HB96 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FANCEQ9HB96 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FANCEQ9HB96 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FANCEQ9HB96 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FANCEQ9HB96 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FANCEQ9HB96 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FANCEQ9HB96 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FANCEQ9HB96 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FANCEQ9HB96 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FANCEQ9HB96 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FANCEQ9HB96 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCEQ9HB96 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCEQ9HB96 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCEQ9HB96 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FANCEQ9HB96 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FANCEQ9HB96 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FANCEQ9HB96 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCEQ9HB96 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FANCEQ9HB96 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FANCEQ9HB96 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FANCEQ9HB96 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FANCEQ9HB96 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FANCEQ9HB96 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FANCEQ9HB96 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FANCEQ9HB96 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FANCEQ9HB96 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FANCEQ9HB96 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FANCEQ9HB96 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FANCEQ9HB96 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FANCEQ9HB96 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FANCEQ9HB96 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCEQ9HB96 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCEQ9HB96 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCEQ9HB96 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCEQ9HB96 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCEQ9HB96 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCEQ9HB96 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCEQ9HB96 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCEQ9HB96 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCEQ9HB96 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCEQ9HB96 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCEQ9HB96 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCEQ9HB96 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCEQ9HB96 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCEQ9HB96 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCEQ9HB96 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCEQ9HB96 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCEQ9HB96 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCEQ9HB96 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCEQ9HB96 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCEQ9HB96 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCEQ9HB96 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCEQ9HB96 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCEQ9HB96 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCEQ9HB96 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCEQ9HB96 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCEQ9HB96 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCEQ9HB96 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCEQ9HB96 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCEQ9HB96 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCEQ9HB96 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
FANCEQ9HB96 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCEQ9HB96 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCEQ9HB96 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCEQ9HB96 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FANCEQ9HB96 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCEQ9HB96 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCEQ9HB96 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCEQ9HB96 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCEQ9HB96 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FANCEQ9HB96 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCEQ9HB96 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCEQ9HB96 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCEQ9HB96 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCEQ9HB96 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FANCEQ9HB96 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FANCEQ9HB96 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FANCEQ9HB96 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FANCEQ9HB96 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FANCEQ9HB96 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FANCEQ9HB96 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FANCEQ9HB96 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FANCEQ9HB96 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FANCEQ9HB96 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FANCEQ9HB96 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FANCEQ9HB96 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FANCEQ9HB96 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FANCEQ9HB96 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FANCEQ9HB96 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
FANCEQ9HB96 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCEQ9HB96 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCEQ9HB96 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCEQ9HB96 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FANCEQ9HB96 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCEQ9HB96 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCEQ9HB96 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCEQ9HB96 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FANCEQ9HB96 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms