Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP13A3Q9H7F0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATP13A3Q9H7F0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP13A3Q9H7F0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATP13A3Q9H7F0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP13A3Q9H7F0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATP13A3Q9H7F0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP13A3Q9H7F0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP13A3Q9H7F0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATP13A3Q9H7F0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATP13A3Q9H7F0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP13A3Q9H7F0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP13A3Q9H7F0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATP13A3Q9H7F0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATP13A3Q9H7F0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP13A3Q9H7F0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP13A3Q9H7F0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP13A3Q9H7F0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP13A3Q9H7F0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP13A3Q9H7F0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP13A3Q9H7F0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP13A3Q9H7F0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP13A3Q9H7F0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP13A3Q9H7F0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP13A3Q9H7F0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP13A3Q9H7F0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP13A3Q9H7F0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
ATP13A3Q9H7F0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP13A3Q9H7F0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP13A3Q9H7F0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP13A3Q9H7F0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP13A3Q9H7F0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP13A3Q9H7F0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP13A3Q9H7F0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP13A3Q9H7F0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP13A3Q9H7F0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP13A3Q9H7F0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP13A3Q9H7F0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP13A3Q9H7F0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATP13A3Q9H7F0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP13A3Q9H7F0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP13A3Q9H7F0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP13A3Q9H7F0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP13A3Q9H7F0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP13A3Q9H7F0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP13A3Q9H7F0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP13A3Q9H7F0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP13A3Q9H7F0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP13A3Q9H7F0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP13A3Q9H7F0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATP13A3Q9H7F0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATP13A3Q9H7F0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP13A3Q9H7F0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP13A3Q9H7F0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP13A3Q9H7F0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATP13A3Q9H7F0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATP13A3Q9H7F0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATP13A3Q9H7F0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATP13A3Q9H7F0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP13A3Q9H7F0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP13A3Q9H7F0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATP13A3Q9H7F0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATP13A3Q9H7F0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP13A3Q9H7F0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP13A3Q9H7F0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATP13A3Q9H7F0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP13A3Q9H7F0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP13A3Q9H7F0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP13A3Q9H7F0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATP13A3Q9H7F0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP13A3Q9H7F0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATP13A3Q9H7F0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ATP13A3Q9H7F0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP13A3Q9H7F0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP13A3Q9H7F0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATP13A3Q9H7F0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP13A3Q9H7F0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP13A3Q9H7F0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATP13A3Q9H7F0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATP13A3Q9H7F0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP13A3Q9H7F0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP13A3Q9H7F0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP13A3Q9H7F0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP13A3Q9H7F0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP13A3Q9H7F0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ATP13A3Q9H7F0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP13A3Q9H7F0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP13A3Q9H7F0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATP13A3Q9H7F0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATP13A3Q9H7F0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP13A3Q9H7F0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP13A3Q9H7F0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP13A3Q9H7F0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP13A3Q9H7F0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP13A3Q9H7F0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATP13A3Q9H7F0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ATP13A3Q9H7F0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP13A3Q9H7F0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATP13A3Q9H7F0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATP13A3Q9H7F0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms