Protein–RNA interactions for Protein: Q96T21

SECISBP2, Selenocysteine insertion sequence-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SECISBP2Q96T21 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SECISBP2Q96T21 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SECISBP2Q96T21 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SECISBP2Q96T21 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SECISBP2Q96T21 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SECISBP2Q96T21 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SECISBP2Q96T21 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SECISBP2Q96T21 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SECISBP2Q96T21 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SECISBP2Q96T21 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SECISBP2Q96T21 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SECISBP2Q96T21 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SECISBP2Q96T21 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SECISBP2Q96T21 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SECISBP2Q96T21 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SECISBP2Q96T21 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SECISBP2Q96T21 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SECISBP2Q96T21 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SECISBP2Q96T21 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SECISBP2Q96T21 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SECISBP2Q96T21 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SECISBP2Q96T21 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SECISBP2Q96T21 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SECISBP2Q96T21 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SECISBP2Q96T21 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SECISBP2Q96T21 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SECISBP2Q96T21 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SECISBP2Q96T21 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SECISBP2Q96T21 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SECISBP2Q96T21 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SECISBP2Q96T21 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SECISBP2Q96T21 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SECISBP2Q96T21 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SECISBP2Q96T21 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SECISBP2Q96T21 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SECISBP2Q96T21 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SECISBP2Q96T21 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SECISBP2Q96T21 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SECISBP2Q96T21 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SECISBP2Q96T21 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SECISBP2Q96T21 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SECISBP2Q96T21 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SECISBP2Q96T21 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SECISBP2Q96T21 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SECISBP2Q96T21 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SECISBP2Q96T21 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SECISBP2Q96T21 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SECISBP2Q96T21 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SECISBP2Q96T21 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SECISBP2Q96T21 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SECISBP2Q96T21 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SECISBP2Q96T21 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SECISBP2Q96T21 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SECISBP2Q96T21 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SECISBP2Q96T21 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SECISBP2Q96T21 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SECISBP2Q96T21 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SECISBP2Q96T21 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SECISBP2Q96T21 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SECISBP2Q96T21 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SECISBP2Q96T21 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SECISBP2Q96T21 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SECISBP2Q96T21 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SECISBP2Q96T21 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SECISBP2Q96T21 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SECISBP2Q96T21 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SECISBP2Q96T21 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SECISBP2Q96T21 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SECISBP2Q96T21 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SECISBP2Q96T21 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SECISBP2Q96T21 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SECISBP2Q96T21 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SECISBP2Q96T21 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SECISBP2Q96T21 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SECISBP2Q96T21 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SECISBP2Q96T21 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SECISBP2Q96T21 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SECISBP2Q96T21 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SECISBP2Q96T21 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SECISBP2Q96T21 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SECISBP2Q96T21 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SECISBP2Q96T21 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SECISBP2Q96T21 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SECISBP2Q96T21 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SECISBP2Q96T21 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SECISBP2Q96T21 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SECISBP2Q96T21 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SECISBP2Q96T21 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SECISBP2Q96T21 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SECISBP2Q96T21 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SECISBP2Q96T21 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SECISBP2Q96T21 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SECISBP2Q96T21 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SECISBP2Q96T21 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SECISBP2Q96T21 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SECISBP2Q96T21 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SECISBP2Q96T21 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SECISBP2Q96T21 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SECISBP2Q96T21 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SECISBP2Q96T21 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms