Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAPPC9Q96Q05 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAPPC9Q96Q05 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAPPC9Q96Q05 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC9Q96Q05 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC9Q96Q05 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC9Q96Q05 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAPPC9Q96Q05 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC9Q96Q05 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAPPC9Q96Q05 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC9Q96Q05 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAPPC9Q96Q05 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC9Q96Q05 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC9Q96Q05 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC9Q96Q05 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAPPC9Q96Q05 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAPPC9Q96Q05 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC9Q96Q05 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAPPC9Q96Q05 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRAPPC9Q96Q05 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC9Q96Q05 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAPPC9Q96Q05 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC9Q96Q05 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC9Q96Q05 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAPPC9Q96Q05 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC9Q96Q05 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC9Q96Q05 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAPPC9Q96Q05 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC9Q96Q05 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAPPC9Q96Q05 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC9Q96Q05 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC9Q96Q05 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC9Q96Q05 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAPPC9Q96Q05 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRAPPC9Q96Q05 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC9Q96Q05 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC9Q96Q05 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRAPPC9Q96Q05 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC9Q96Q05 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC9Q96Q05 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC9Q96Q05 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TRAPPC9Q96Q05 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRAPPC9Q96Q05 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC9Q96Q05 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC9Q96Q05 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRAPPC9Q96Q05 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC9Q96Q05 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRAPPC9Q96Q05 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC9Q96Q05 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRAPPC9Q96Q05 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC9Q96Q05 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC9Q96Q05 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRAPPC9Q96Q05 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC9Q96Q05 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRAPPC9Q96Q05 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC9Q96Q05 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC9Q96Q05 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC9Q96Q05 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC9Q96Q05 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC9Q96Q05 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRAPPC9Q96Q05 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC9Q96Q05 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRAPPC9Q96Q05 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC9Q96Q05 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRAPPC9Q96Q05 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC9Q96Q05 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC9Q96Q05 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRAPPC9Q96Q05 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAPPC9Q96Q05 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC9Q96Q05 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC9Q96Q05 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAPPC9Q96Q05 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC9Q96Q05 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAPPC9Q96Q05 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRAPPC9Q96Q05 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAPPC9Q96Q05 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC9Q96Q05 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAPPC9Q96Q05 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC9Q96Q05 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC9Q96Q05 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC9Q96Q05 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC9Q96Q05 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAPPC9Q96Q05 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC9Q96Q05 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC9Q96Q05 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC9Q96Q05 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAPPC9Q96Q05 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC9Q96Q05 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC9Q96Q05 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAPPC9Q96Q05 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC9Q96Q05 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAPPC9Q96Q05 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC9Q96Q05 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAPPC9Q96Q05 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC9Q96Q05 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAPPC9Q96Q05 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAPPC9Q96Q05 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms