Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
TRAPPC9Q96Q05 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
TRAPPC9Q96Q05 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TRAPPC9Q96Q05 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TRAPPC9Q96Q05 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
TRAPPC9Q96Q05 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
TRAPPC9Q96Q05 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
TRAPPC9Q96Q05 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
TRAPPC9Q96Q05 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
TRAPPC9Q96Q05 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRAPPC9Q96Q05 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRAPPC9Q96Q05 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAPPC9Q96Q05 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TRAPPC9Q96Q05 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TRAPPC9Q96Q05 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRAPPC9Q96Q05 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRAPPC9Q96Q05 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
TRAPPC9Q96Q05 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRAPPC9Q96Q05 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRAPPC9Q96Q05 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
TRAPPC9Q96Q05 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TRAPPC9Q96Q05 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TRAPPC9Q96Q05 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TRAPPC9Q96Q05 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TRAPPC9Q96Q05 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
TRAPPC9Q96Q05 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
TRAPPC9Q96Q05 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
TRAPPC9Q96Q05 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TRAPPC9Q96Q05 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TRAPPC9Q96Q05 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC9Q96Q05 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TRAPPC9Q96Q05 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TRAPPC9Q96Q05 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TRAPPC9Q96Q05 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC9Q96Q05 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC9Q96Q05 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC9Q96Q05 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC9Q96Q05 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC9Q96Q05 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC9Q96Q05 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TRAPPC9Q96Q05 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC9Q96Q05 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRAPPC9Q96Q05 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC9Q96Q05 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRAPPC9Q96Q05 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC9Q96Q05 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC9Q96Q05 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRAPPC9Q96Q05 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC9Q96Q05 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRAPPC9Q96Q05 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TRAPPC9Q96Q05 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TRAPPC9Q96Q05 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TRAPPC9Q96Q05 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TRAPPC9Q96Q05 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC9Q96Q05 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TRAPPC9Q96Q05 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC9Q96Q05 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRAPPC9Q96Q05 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRAPPC9Q96Q05 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRAPPC9Q96Q05 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC9Q96Q05 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC9Q96Q05 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC9Q96Q05 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC9Q96Q05 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC9Q96Q05 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TRAPPC9Q96Q05 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC9Q96Q05 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TRAPPC9Q96Q05 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TRAPPC9Q96Q05 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC9Q96Q05 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TRAPPC9Q96Q05 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC9Q96Q05 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TRAPPC9Q96Q05 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC9Q96Q05 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC9Q96Q05 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC9Q96Q05 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC9Q96Q05 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRAPPC9Q96Q05 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC9Q96Q05 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC9Q96Q05 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRAPPC9Q96Q05 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC9Q96Q05 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC9Q96Q05 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC9Q96Q05 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TRAPPC9Q96Q05 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC9Q96Q05 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC9Q96Q05 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC9Q96Q05 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRAPPC9Q96Q05 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TRAPPC9Q96Q05 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC9Q96Q05 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC9Q96Q05 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC9Q96Q05 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC9Q96Q05 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC9Q96Q05 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC9Q96Q05 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC9Q96Q05 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TRAPPC9Q96Q05 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms