Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCMH1Q96GD3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCMH1Q96GD3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCMH1Q96GD3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCMH1Q96GD3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCMH1Q96GD3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCMH1Q96GD3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCMH1Q96GD3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCMH1Q96GD3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCMH1Q96GD3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCMH1Q96GD3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCMH1Q96GD3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCMH1Q96GD3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCMH1Q96GD3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCMH1Q96GD3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCMH1Q96GD3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCMH1Q96GD3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCMH1Q96GD3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCMH1Q96GD3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCMH1Q96GD3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCMH1Q96GD3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCMH1Q96GD3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCMH1Q96GD3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCMH1Q96GD3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCMH1Q96GD3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCMH1Q96GD3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCMH1Q96GD3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCMH1Q96GD3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCMH1Q96GD3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCMH1Q96GD3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCMH1Q96GD3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCMH1Q96GD3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCMH1Q96GD3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SCMH1Q96GD3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCMH1Q96GD3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SCMH1Q96GD3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SCMH1Q96GD3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCMH1Q96GD3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SCMH1Q96GD3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SCMH1Q96GD3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCMH1Q96GD3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCMH1Q96GD3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCMH1Q96GD3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SCMH1Q96GD3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SCMH1Q96GD3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SCMH1Q96GD3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SCMH1Q96GD3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCMH1Q96GD3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SCMH1Q96GD3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SCMH1Q96GD3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SCMH1Q96GD3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SCMH1Q96GD3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCMH1Q96GD3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SCMH1Q96GD3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SCMH1Q96GD3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCMH1Q96GD3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCMH1Q96GD3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SCMH1Q96GD3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCMH1Q96GD3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCMH1Q96GD3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SCMH1Q96GD3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCMH1Q96GD3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCMH1Q96GD3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCMH1Q96GD3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCMH1Q96GD3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCMH1Q96GD3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SCMH1Q96GD3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SCMH1Q96GD3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SCMH1Q96GD3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCMH1Q96GD3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SCMH1Q96GD3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCMH1Q96GD3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCMH1Q96GD3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCMH1Q96GD3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCMH1Q96GD3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCMH1Q96GD3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCMH1Q96GD3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCMH1Q96GD3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCMH1Q96GD3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCMH1Q96GD3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCMH1Q96GD3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCMH1Q96GD3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCMH1Q96GD3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCMH1Q96GD3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCMH1Q96GD3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCMH1Q96GD3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCMH1Q96GD3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCMH1Q96GD3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCMH1Q96GD3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCMH1Q96GD3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCMH1Q96GD3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCMH1Q96GD3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCMH1Q96GD3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCMH1Q96GD3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCMH1Q96GD3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCMH1Q96GD3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCMH1Q96GD3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCMH1Q96GD3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCMH1Q96GD3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SCMH1Q96GD3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms