Protein–RNA interactions for Protein: Q96FW1

OTUB1, Ubiquitin thioesterase OTUB1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB1Q96FW1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
OTUB1Q96FW1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
OTUB1Q96FW1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUB1Q96FW1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
OTUB1Q96FW1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUB1Q96FW1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUB1Q96FW1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUB1Q96FW1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
OTUB1Q96FW1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUB1Q96FW1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
OTUB1Q96FW1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTUB1Q96FW1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTUB1Q96FW1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUB1Q96FW1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUB1Q96FW1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUB1Q96FW1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTUB1Q96FW1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTUB1Q96FW1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
OTUB1Q96FW1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTUB1Q96FW1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUB1Q96FW1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTUB1Q96FW1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTUB1Q96FW1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTUB1Q96FW1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUB1Q96FW1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTUB1Q96FW1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUB1Q96FW1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTUB1Q96FW1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUB1Q96FW1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTUB1Q96FW1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUB1Q96FW1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUB1Q96FW1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTUB1Q96FW1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
OTUB1Q96FW1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTUB1Q96FW1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTUB1Q96FW1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUB1Q96FW1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUB1Q96FW1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTUB1Q96FW1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTUB1Q96FW1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUB1Q96FW1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTUB1Q96FW1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
OTUB1Q96FW1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTUB1Q96FW1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTUB1Q96FW1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUB1Q96FW1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUB1Q96FW1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUB1Q96FW1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUB1Q96FW1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTUB1Q96FW1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUB1Q96FW1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTUB1Q96FW1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUB1Q96FW1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTUB1Q96FW1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUB1Q96FW1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUB1Q96FW1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUB1Q96FW1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTUB1Q96FW1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTUB1Q96FW1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTUB1Q96FW1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTUB1Q96FW1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTUB1Q96FW1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OTUB1Q96FW1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
OTUB1Q96FW1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
OTUB1Q96FW1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
OTUB1Q96FW1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUB1Q96FW1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUB1Q96FW1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
OTUB1Q96FW1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OTUB1Q96FW1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
OTUB1Q96FW1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTUB1Q96FW1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
OTUB1Q96FW1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
OTUB1Q96FW1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
OTUB1Q96FW1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTUB1Q96FW1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTUB1Q96FW1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTUB1Q96FW1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
OTUB1Q96FW1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUB1Q96FW1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUB1Q96FW1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUB1Q96FW1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
OTUB1Q96FW1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
OTUB1Q96FW1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTUB1Q96FW1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
OTUB1Q96FW1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
OTUB1Q96FW1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTUB1Q96FW1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTUB1Q96FW1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
OTUB1Q96FW1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
OTUB1Q96FW1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTUB1Q96FW1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTUB1Q96FW1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
OTUB1Q96FW1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
OTUB1Q96FW1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
OTUB1Q96FW1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTUB1Q96FW1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTUB1Q96FW1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
OTUB1Q96FW1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
OTUB1Q96FW1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms