Protein–RNA interactions for Protein: Q96FT9

IFT43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT43Q96FT9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
IFT43Q96FT9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT43Q96FT9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT43Q96FT9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
IFT43Q96FT9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT43Q96FT9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
IFT43Q96FT9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT43Q96FT9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT43Q96FT9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT43Q96FT9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT43Q96FT9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
IFT43Q96FT9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT43Q96FT9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT43Q96FT9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
IFT43Q96FT9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
IFT43Q96FT9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
IFT43Q96FT9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT43Q96FT9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT43Q96FT9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT43Q96FT9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT43Q96FT9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
IFT43Q96FT9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
IFT43Q96FT9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT43Q96FT9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT43Q96FT9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
IFT43Q96FT9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
IFT43Q96FT9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT43Q96FT9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
IFT43Q96FT9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT43Q96FT9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
IFT43Q96FT9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT43Q96FT9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
IFT43Q96FT9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT43Q96FT9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT43Q96FT9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
IFT43Q96FT9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
IFT43Q96FT9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFT43Q96FT9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
IFT43Q96FT9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
IFT43Q96FT9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
IFT43Q96FT9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.55■■■□□ 2
IFT43Q96FT9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
IFT43Q96FT9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
IFT43Q96FT9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
IFT43Q96FT9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.54■■■□□ 2
IFT43Q96FT9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
IFT43Q96FT9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IFT43Q96FT9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IFT43Q96FT9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
IFT43Q96FT9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
IFT43Q96FT9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
IFT43Q96FT9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT43Q96FT9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
IFT43Q96FT9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT43Q96FT9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT43Q96FT9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
IFT43Q96FT9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
IFT43Q96FT9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT43Q96FT9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
IFT43Q96FT9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
IFT43Q96FT9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT43Q96FT9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT43Q96FT9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
IFT43Q96FT9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT43Q96FT9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IFT43Q96FT9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT43Q96FT9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
IFT43Q96FT9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IFT43Q96FT9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT43Q96FT9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
IFT43Q96FT9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IFT43Q96FT9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT43Q96FT9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
IFT43Q96FT9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
IFT43Q96FT9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT43Q96FT9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
IFT43Q96FT9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IFT43Q96FT9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT43Q96FT9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IFT43Q96FT9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT43Q96FT9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT43Q96FT9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
IFT43Q96FT9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IFT43Q96FT9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT43Q96FT9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IFT43Q96FT9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT43Q96FT9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
IFT43Q96FT9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
IFT43Q96FT9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT43Q96FT9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT43Q96FT9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IFT43Q96FT9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT43Q96FT9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT43Q96FT9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT43Q96FT9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT43Q96FT9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IFT43Q96FT9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT43Q96FT9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT43Q96FT9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IFT43Q96FT9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms