Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTERF3Q96E29 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTERF3Q96E29 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MTERF3Q96E29 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTERF3Q96E29 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MTERF3Q96E29 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTERF3Q96E29 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTERF3Q96E29 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MTERF3Q96E29 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTERF3Q96E29 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MTERF3Q96E29 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTERF3Q96E29 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTERF3Q96E29 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MTERF3Q96E29 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTERF3Q96E29 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MTERF3Q96E29 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTERF3Q96E29 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MTERF3Q96E29 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MTERF3Q96E29 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTERF3Q96E29 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MTERF3Q96E29 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTERF3Q96E29 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTERF3Q96E29 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTERF3Q96E29 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MTERF3Q96E29 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTERF3Q96E29 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MTERF3Q96E29 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTERF3Q96E29 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MTERF3Q96E29 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MTERF3Q96E29 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTERF3Q96E29 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTERF3Q96E29 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTERF3Q96E29 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MTERF3Q96E29 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTERF3Q96E29 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MTERF3Q96E29 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTERF3Q96E29 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MTERF3Q96E29 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTERF3Q96E29 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTERF3Q96E29 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MTERF3Q96E29 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTERF3Q96E29 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTERF3Q96E29 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTERF3Q96E29 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MTERF3Q96E29 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTERF3Q96E29 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTERF3Q96E29 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MTERF3Q96E29 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTERF3Q96E29 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MTERF3Q96E29 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
MTERF3Q96E29 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTERF3Q96E29 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTERF3Q96E29 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTERF3Q96E29 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MTERF3Q96E29 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MTERF3Q96E29 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTERF3Q96E29 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTERF3Q96E29 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MTERF3Q96E29 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MTERF3Q96E29 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MTERF3Q96E29 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MTERF3Q96E29 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
MTERF3Q96E29 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MTERF3Q96E29 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MTERF3Q96E29 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTERF3Q96E29 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTERF3Q96E29 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MTERF3Q96E29 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MTERF3Q96E29 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
MTERF3Q96E29 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTERF3Q96E29 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTERF3Q96E29 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MTERF3Q96E29 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTERF3Q96E29 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MTERF3Q96E29 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MTERF3Q96E29 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MTERF3Q96E29 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTERF3Q96E29 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTERF3Q96E29 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTERF3Q96E29 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MTERF3Q96E29 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MTERF3Q96E29 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTERF3Q96E29 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTERF3Q96E29 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTERF3Q96E29 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MTERF3Q96E29 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTERF3Q96E29 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MTERF3Q96E29 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTERF3Q96E29 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTERF3Q96E29 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MTERF3Q96E29 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MTERF3Q96E29 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTERF3Q96E29 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MTERF3Q96E29 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTERF3Q96E29 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTERF3Q96E29 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTERF3Q96E29 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MTERF3Q96E29 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTERF3Q96E29 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTERF3Q96E29 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms