Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF47

ZFP90, Zinc finger protein 90 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP90Q8TF47 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZFP90Q8TF47 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZFP90Q8TF47 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZFP90Q8TF47 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZFP90Q8TF47 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZFP90Q8TF47 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZFP90Q8TF47 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZFP90Q8TF47 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZFP90Q8TF47 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZFP90Q8TF47 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZFP90Q8TF47 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZFP90Q8TF47 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZFP90Q8TF47 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZFP90Q8TF47 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZFP90Q8TF47 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZFP90Q8TF47 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZFP90Q8TF47 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZFP90Q8TF47 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZFP90Q8TF47 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZFP90Q8TF47 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZFP90Q8TF47 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZFP90Q8TF47 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZFP90Q8TF47 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZFP90Q8TF47 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZFP90Q8TF47 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZFP90Q8TF47 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZFP90Q8TF47 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZFP90Q8TF47 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZFP90Q8TF47 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZFP90Q8TF47 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZFP90Q8TF47 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZFP90Q8TF47 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZFP90Q8TF47 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZFP90Q8TF47 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZFP90Q8TF47 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZFP90Q8TF47 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZFP90Q8TF47 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZFP90Q8TF47 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZFP90Q8TF47 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZFP90Q8TF47 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZFP90Q8TF47 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZFP90Q8TF47 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZFP90Q8TF47 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZFP90Q8TF47 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZFP90Q8TF47 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZFP90Q8TF47 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZFP90Q8TF47 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZFP90Q8TF47 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZFP90Q8TF47 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZFP90Q8TF47 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZFP90Q8TF47 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZFP90Q8TF47 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZFP90Q8TF47 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZFP90Q8TF47 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZFP90Q8TF47 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZFP90Q8TF47 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZFP90Q8TF47 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZFP90Q8TF47 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZFP90Q8TF47 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZFP90Q8TF47 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZFP90Q8TF47 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZFP90Q8TF47 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZFP90Q8TF47 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZFP90Q8TF47 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFP90Q8TF47 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFP90Q8TF47 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZFP90Q8TF47 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZFP90Q8TF47 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZFP90Q8TF47 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZFP90Q8TF47 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZFP90Q8TF47 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZFP90Q8TF47 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZFP90Q8TF47 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZFP90Q8TF47 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZFP90Q8TF47 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZFP90Q8TF47 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFP90Q8TF47 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFP90Q8TF47 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZFP90Q8TF47 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZFP90Q8TF47 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZFP90Q8TF47 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZFP90Q8TF47 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFP90Q8TF47 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZFP90Q8TF47 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFP90Q8TF47 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFP90Q8TF47 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZFP90Q8TF47 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFP90Q8TF47 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFP90Q8TF47 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFP90Q8TF47 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFP90Q8TF47 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZFP90Q8TF47 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFP90Q8TF47 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFP90Q8TF47 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFP90Q8TF47 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFP90Q8TF47 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZFP90Q8TF47 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZFP90Q8TF47 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFP90Q8TF47 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFP90Q8TF47 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms