Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
HELQQ8TDG4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
HELQQ8TDG4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
HELQQ8TDG4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HELQQ8TDG4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
HELQQ8TDG4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
HELQQ8TDG4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
HELQQ8TDG4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
HELQQ8TDG4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
HELQQ8TDG4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HELQQ8TDG4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HELQQ8TDG4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HELQQ8TDG4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HELQQ8TDG4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HELQQ8TDG4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HELQQ8TDG4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HELQQ8TDG4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HELQQ8TDG4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HELQQ8TDG4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
HELQQ8TDG4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HELQQ8TDG4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HELQQ8TDG4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HELQQ8TDG4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HELQQ8TDG4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
HELQQ8TDG4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
HELQQ8TDG4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HELQQ8TDG4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HELQQ8TDG4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HELQQ8TDG4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HELQQ8TDG4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
HELQQ8TDG4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HELQQ8TDG4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HELQQ8TDG4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HELQQ8TDG4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HELQQ8TDG4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HELQQ8TDG4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HELQQ8TDG4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HELQQ8TDG4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HELQQ8TDG4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
HELQQ8TDG4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HELQQ8TDG4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HELQQ8TDG4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
HELQQ8TDG4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
HELQQ8TDG4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HELQQ8TDG4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HELQQ8TDG4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HELQQ8TDG4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HELQQ8TDG4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HELQQ8TDG4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HELQQ8TDG4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HELQQ8TDG4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HELQQ8TDG4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HELQQ8TDG4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HELQQ8TDG4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HELQQ8TDG4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HELQQ8TDG4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HELQQ8TDG4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HELQQ8TDG4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HELQQ8TDG4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HELQQ8TDG4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HELQQ8TDG4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HELQQ8TDG4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HELQQ8TDG4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HELQQ8TDG4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HELQQ8TDG4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
HELQQ8TDG4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HELQQ8TDG4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HELQQ8TDG4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HELQQ8TDG4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HELQQ8TDG4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HELQQ8TDG4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HELQQ8TDG4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HELQQ8TDG4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
HELQQ8TDG4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HELQQ8TDG4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HELQQ8TDG4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HELQQ8TDG4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
HELQQ8TDG4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HELQQ8TDG4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HELQQ8TDG4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HELQQ8TDG4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HELQQ8TDG4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
HELQQ8TDG4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HELQQ8TDG4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HELQQ8TDG4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HELQQ8TDG4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HELQQ8TDG4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HELQQ8TDG4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HELQQ8TDG4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
HELQQ8TDG4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
HELQQ8TDG4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HELQQ8TDG4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HELQQ8TDG4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
HELQQ8TDG4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HELQQ8TDG4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HELQQ8TDG4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
HELQQ8TDG4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HELQQ8TDG4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HELQQ8TDG4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HELQQ8TDG4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms