Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
HELQQ8TDG4 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
HELQQ8TDG4 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
HELQQ8TDG4 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
HELQQ8TDG4 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
HELQQ8TDG4 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
HELQQ8TDG4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
HELQQ8TDG4 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
HELQQ8TDG4 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
HELQQ8TDG4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
HELQQ8TDG4 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HELQQ8TDG4 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
HELQQ8TDG4 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
HELQQ8TDG4 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
HELQQ8TDG4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
HELQQ8TDG4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
HELQQ8TDG4 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
HELQQ8TDG4 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
HELQQ8TDG4 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
HELQQ8TDG4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
HELQQ8TDG4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
HELQQ8TDG4 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
HELQQ8TDG4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
HELQQ8TDG4 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
HELQQ8TDG4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HELQQ8TDG4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HELQQ8TDG4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
HELQQ8TDG4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
HELQQ8TDG4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
HELQQ8TDG4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HELQQ8TDG4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HELQQ8TDG4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
HELQQ8TDG4 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HELQQ8TDG4 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HELQQ8TDG4 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
HELQQ8TDG4 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
HELQQ8TDG4 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HELQQ8TDG4 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HELQQ8TDG4 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HELQQ8TDG4 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HELQQ8TDG4 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
HELQQ8TDG4 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
HELQQ8TDG4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
HELQQ8TDG4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
HELQQ8TDG4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
HELQQ8TDG4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
HELQQ8TDG4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
HELQQ8TDG4 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
HELQQ8TDG4 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HELQQ8TDG4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
HELQQ8TDG4 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HELQQ8TDG4 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
HELQQ8TDG4 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HELQQ8TDG4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
HELQQ8TDG4 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
HELQQ8TDG4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HELQQ8TDG4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
HELQQ8TDG4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
HELQQ8TDG4 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
HELQQ8TDG4 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.85
HELQQ8TDG4 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HELQQ8TDG4 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HELQQ8TDG4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
HELQQ8TDG4 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
HELQQ8TDG4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
HELQQ8TDG4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
HELQQ8TDG4 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
HELQQ8TDG4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
HELQQ8TDG4 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
HELQQ8TDG4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
HELQQ8TDG4 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
HELQQ8TDG4 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
HELQQ8TDG4 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
HELQQ8TDG4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
HELQQ8TDG4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
HELQQ8TDG4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
HELQQ8TDG4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
HELQQ8TDG4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
HELQQ8TDG4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
HELQQ8TDG4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
HELQQ8TDG4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HELQQ8TDG4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
HELQQ8TDG4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
HELQQ8TDG4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
HELQQ8TDG4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
HELQQ8TDG4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
HELQQ8TDG4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
HELQQ8TDG4 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
HELQQ8TDG4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HELQQ8TDG4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
HELQQ8TDG4 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
HELQQ8TDG4 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
HELQQ8TDG4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
HELQQ8TDG4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
HELQQ8TDG4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
HELQQ8TDG4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
HELQQ8TDG4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
HELQQ8TDG4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
HELQQ8TDG4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
HELQQ8TDG4 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms