Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIN3Q8TB24 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RIN3Q8TB24 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RIN3Q8TB24 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RIN3Q8TB24 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RIN3Q8TB24 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RIN3Q8TB24 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RIN3Q8TB24 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RIN3Q8TB24 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RIN3Q8TB24 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RIN3Q8TB24 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
RIN3Q8TB24 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RIN3Q8TB24 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RIN3Q8TB24 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIN3Q8TB24 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RIN3Q8TB24 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIN3Q8TB24 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RIN3Q8TB24 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIN3Q8TB24 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIN3Q8TB24 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RIN3Q8TB24 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
RIN3Q8TB24 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIN3Q8TB24 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RIN3Q8TB24 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIN3Q8TB24 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RIN3Q8TB24 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIN3Q8TB24 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIN3Q8TB24 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIN3Q8TB24 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RIN3Q8TB24 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RIN3Q8TB24 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RIN3Q8TB24 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RIN3Q8TB24 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
RIN3Q8TB24 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RIN3Q8TB24 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RIN3Q8TB24 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RIN3Q8TB24 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RIN3Q8TB24 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RIN3Q8TB24 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RIN3Q8TB24 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RIN3Q8TB24 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RIN3Q8TB24 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RIN3Q8TB24 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RIN3Q8TB24 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RIN3Q8TB24 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RIN3Q8TB24 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RIN3Q8TB24 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RIN3Q8TB24 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RIN3Q8TB24 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RIN3Q8TB24 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RIN3Q8TB24 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RIN3Q8TB24 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIN3Q8TB24 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RIN3Q8TB24 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RIN3Q8TB24 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIN3Q8TB24 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIN3Q8TB24 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RIN3Q8TB24 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIN3Q8TB24 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RIN3Q8TB24 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIN3Q8TB24 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RIN3Q8TB24 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RIN3Q8TB24 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIN3Q8TB24 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIN3Q8TB24 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RIN3Q8TB24 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIN3Q8TB24 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIN3Q8TB24 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RIN3Q8TB24 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
RIN3Q8TB24 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIN3Q8TB24 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIN3Q8TB24 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RIN3Q8TB24 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RIN3Q8TB24 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RIN3Q8TB24 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIN3Q8TB24 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIN3Q8TB24 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RIN3Q8TB24 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIN3Q8TB24 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIN3Q8TB24 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RIN3Q8TB24 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIN3Q8TB24 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIN3Q8TB24 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RIN3Q8TB24 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIN3Q8TB24 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIN3Q8TB24 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RIN3Q8TB24 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RIN3Q8TB24 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIN3Q8TB24 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIN3Q8TB24 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIN3Q8TB24 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RIN3Q8TB24 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RIN3Q8TB24 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RIN3Q8TB24 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIN3Q8TB24 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIN3Q8TB24 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIN3Q8TB24 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RIN3Q8TB24 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIN3Q8TB24 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RIN3Q8TB24 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms