Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT5

NEIL3, Endonuclease 8-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL3Q8TAT5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NEIL3Q8TAT5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEIL3Q8TAT5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NEIL3Q8TAT5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NEIL3Q8TAT5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NEIL3Q8TAT5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEIL3Q8TAT5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEIL3Q8TAT5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEIL3Q8TAT5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEIL3Q8TAT5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEIL3Q8TAT5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEIL3Q8TAT5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NEIL3Q8TAT5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEIL3Q8TAT5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEIL3Q8TAT5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEIL3Q8TAT5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEIL3Q8TAT5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEIL3Q8TAT5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEIL3Q8TAT5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEIL3Q8TAT5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEIL3Q8TAT5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NEIL3Q8TAT5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
NEIL3Q8TAT5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEIL3Q8TAT5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEIL3Q8TAT5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NEIL3Q8TAT5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEIL3Q8TAT5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEIL3Q8TAT5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NEIL3Q8TAT5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NEIL3Q8TAT5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NEIL3Q8TAT5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEIL3Q8TAT5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEIL3Q8TAT5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NEIL3Q8TAT5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEIL3Q8TAT5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEIL3Q8TAT5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
NEIL3Q8TAT5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEIL3Q8TAT5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEIL3Q8TAT5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NEIL3Q8TAT5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NEIL3Q8TAT5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NEIL3Q8TAT5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NEIL3Q8TAT5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEIL3Q8TAT5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEIL3Q8TAT5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NEIL3Q8TAT5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEIL3Q8TAT5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NEIL3Q8TAT5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NEIL3Q8TAT5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEIL3Q8TAT5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEIL3Q8TAT5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NEIL3Q8TAT5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEIL3Q8TAT5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEIL3Q8TAT5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NEIL3Q8TAT5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEIL3Q8TAT5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEIL3Q8TAT5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NEIL3Q8TAT5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEIL3Q8TAT5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NEIL3Q8TAT5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NEIL3Q8TAT5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEIL3Q8TAT5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NEIL3Q8TAT5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NEIL3Q8TAT5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NEIL3Q8TAT5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEIL3Q8TAT5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NEIL3Q8TAT5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEIL3Q8TAT5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NEIL3Q8TAT5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEIL3Q8TAT5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEIL3Q8TAT5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEIL3Q8TAT5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NEIL3Q8TAT5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEIL3Q8TAT5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEIL3Q8TAT5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEIL3Q8TAT5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEIL3Q8TAT5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEIL3Q8TAT5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEIL3Q8TAT5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEIL3Q8TAT5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEIL3Q8TAT5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEIL3Q8TAT5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEIL3Q8TAT5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEIL3Q8TAT5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEIL3Q8TAT5 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEIL3Q8TAT5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEIL3Q8TAT5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEIL3Q8TAT5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEIL3Q8TAT5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEIL3Q8TAT5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NEIL3Q8TAT5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEIL3Q8TAT5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEIL3Q8TAT5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NEIL3Q8TAT5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEIL3Q8TAT5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEIL3Q8TAT5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEIL3Q8TAT5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEIL3Q8TAT5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NEIL3Q8TAT5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NEIL3Q8TAT5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms