Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF548Q8NEK5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF548Q8NEK5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF548Q8NEK5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF548Q8NEK5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF548Q8NEK5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF548Q8NEK5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF548Q8NEK5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF548Q8NEK5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF548Q8NEK5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ZNF548Q8NEK5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
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