Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF548Q8NEK5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF548Q8NEK5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF548Q8NEK5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF548Q8NEK5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF548Q8NEK5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF548Q8NEK5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF548Q8NEK5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF548Q8NEK5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF548Q8NEK5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF548Q8NEK5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF548Q8NEK5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF548Q8NEK5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ZNF548Q8NEK5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ZNF548Q8NEK5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF548Q8NEK5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ZNF548Q8NEK5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms