Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZNF548Q8NEK5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNF548Q8NEK5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNF548Q8NEK5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ZNF548Q8NEK5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ZNF548Q8NEK5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
ZNF548Q8NEK5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ZNF548Q8NEK5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
ZNF548Q8NEK5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
ZNF548Q8NEK5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
ZNF548Q8NEK5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
ZNF548Q8NEK5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
ZNF548Q8NEK5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
ZNF548Q8NEK5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ZNF548Q8NEK5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ZNF548Q8NEK5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
ZNF548Q8NEK5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
ZNF548Q8NEK5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ZNF548Q8NEK5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ZNF548Q8NEK5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
ZNF548Q8NEK5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ZNF548Q8NEK5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ZNF548Q8NEK5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ZNF548Q8NEK5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZNF548Q8NEK5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZNF548Q8NEK5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ZNF548Q8NEK5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ZNF548Q8NEK5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZNF548Q8NEK5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZNF548Q8NEK5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZNF548Q8NEK5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ZNF548Q8NEK5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZNF548Q8NEK5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZNF548Q8NEK5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZNF548Q8NEK5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZNF548Q8NEK5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNF548Q8NEK5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZNF548Q8NEK5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZNF548Q8NEK5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZNF548Q8NEK5 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ZNF548Q8NEK5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ZNF548Q8NEK5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF548Q8NEK5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF548Q8NEK5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ZNF548Q8NEK5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ZNF548Q8NEK5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ZNF548Q8NEK5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ZNF548Q8NEK5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ZNF548Q8NEK5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ZNF548Q8NEK5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ZNF548Q8NEK5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ZNF548Q8NEK5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ZNF548Q8NEK5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ZNF548Q8NEK5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ZNF548Q8NEK5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
ZNF548Q8NEK5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
ZNF548Q8NEK5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ZNF548Q8NEK5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ZNF548Q8NEK5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ZNF548Q8NEK5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ZNF548Q8NEK5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ZNF548Q8NEK5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ZNF548Q8NEK5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ZNF548Q8NEK5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ZNF548Q8NEK5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ZNF548Q8NEK5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF548Q8NEK5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF548Q8NEK5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ZNF548Q8NEK5 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ZNF548Q8NEK5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ZNF548Q8NEK5 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ZNF548Q8NEK5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ZNF548Q8NEK5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF548Q8NEK5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
ZNF548Q8NEK5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ZNF548Q8NEK5 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ZNF548Q8NEK5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ZNF548Q8NEK5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ZNF548Q8NEK5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF548Q8NEK5 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF548Q8NEK5 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ZNF548Q8NEK5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ZNF548Q8NEK5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ZNF548Q8NEK5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF548Q8NEK5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF548Q8NEK5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZNF548Q8NEK5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF548Q8NEK5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF548Q8NEK5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZNF548Q8NEK5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZNF548Q8NEK5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZNF548Q8NEK5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZNF548Q8NEK5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZNF548Q8NEK5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZNF548Q8NEK5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZNF548Q8NEK5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ZNF548Q8NEK5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF548Q8NEK5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF548Q8NEK5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ZNF548Q8NEK5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
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