Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ7

SUMF2, Sulfatase-modifying factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF2Q8NBJ7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUMF2Q8NBJ7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUMF2Q8NBJ7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUMF2Q8NBJ7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SUMF2Q8NBJ7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUMF2Q8NBJ7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SUMF2Q8NBJ7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUMF2Q8NBJ7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUMF2Q8NBJ7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SUMF2Q8NBJ7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUMF2Q8NBJ7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SUMF2Q8NBJ7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUMF2Q8NBJ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SUMF2Q8NBJ7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SUMF2Q8NBJ7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SUMF2Q8NBJ7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUMF2Q8NBJ7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUMF2Q8NBJ7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUMF2Q8NBJ7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUMF2Q8NBJ7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUMF2Q8NBJ7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SUMF2Q8NBJ7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUMF2Q8NBJ7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SUMF2Q8NBJ7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUMF2Q8NBJ7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SUMF2Q8NBJ7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUMF2Q8NBJ7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUMF2Q8NBJ7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUMF2Q8NBJ7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUMF2Q8NBJ7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SUMF2Q8NBJ7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUMF2Q8NBJ7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SUMF2Q8NBJ7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SUMF2Q8NBJ7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SUMF2Q8NBJ7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SUMF2Q8NBJ7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SUMF2Q8NBJ7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUMF2Q8NBJ7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUMF2Q8NBJ7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SUMF2Q8NBJ7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SUMF2Q8NBJ7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUMF2Q8NBJ7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUMF2Q8NBJ7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SUMF2Q8NBJ7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SUMF2Q8NBJ7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SUMF2Q8NBJ7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SUMF2Q8NBJ7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUMF2Q8NBJ7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SUMF2Q8NBJ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUMF2Q8NBJ7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUMF2Q8NBJ7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SUMF2Q8NBJ7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUMF2Q8NBJ7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUMF2Q8NBJ7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUMF2Q8NBJ7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUMF2Q8NBJ7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SUMF2Q8NBJ7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SUMF2Q8NBJ7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUMF2Q8NBJ7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SUMF2Q8NBJ7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMF2Q8NBJ7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SUMF2Q8NBJ7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUMF2Q8NBJ7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUMF2Q8NBJ7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUMF2Q8NBJ7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SUMF2Q8NBJ7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMF2Q8NBJ7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMF2Q8NBJ7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SUMF2Q8NBJ7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUMF2Q8NBJ7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SUMF2Q8NBJ7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUMF2Q8NBJ7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUMF2Q8NBJ7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUMF2Q8NBJ7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUMF2Q8NBJ7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SUMF2Q8NBJ7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SUMF2Q8NBJ7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUMF2Q8NBJ7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUMF2Q8NBJ7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUMF2Q8NBJ7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUMF2Q8NBJ7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUMF2Q8NBJ7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SUMF2Q8NBJ7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SUMF2Q8NBJ7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUMF2Q8NBJ7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SUMF2Q8NBJ7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMF2Q8NBJ7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMF2Q8NBJ7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMF2Q8NBJ7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMF2Q8NBJ7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SUMF2Q8NBJ7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMF2Q8NBJ7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMF2Q8NBJ7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SUMF2Q8NBJ7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUMF2Q8NBJ7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUMF2Q8NBJ7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUMF2Q8NBJ7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUMF2Q8NBJ7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUMF2Q8NBJ7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SUMF2Q8NBJ7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms