Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9S9

SNX31, Sorting nexin-31, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX31Q8N9S9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX31Q8N9S9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX31Q8N9S9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX31Q8N9S9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX31Q8N9S9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX31Q8N9S9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX31Q8N9S9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SNX31Q8N9S9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX31Q8N9S9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX31Q8N9S9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SNX31Q8N9S9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX31Q8N9S9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX31Q8N9S9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SNX31Q8N9S9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX31Q8N9S9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNX31Q8N9S9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX31Q8N9S9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX31Q8N9S9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX31Q8N9S9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNX31Q8N9S9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNX31Q8N9S9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX31Q8N9S9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNX31Q8N9S9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX31Q8N9S9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX31Q8N9S9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNX31Q8N9S9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNX31Q8N9S9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNX31Q8N9S9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNX31Q8N9S9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX31Q8N9S9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX31Q8N9S9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNX31Q8N9S9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX31Q8N9S9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNX31Q8N9S9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX31Q8N9S9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNX31Q8N9S9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX31Q8N9S9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNX31Q8N9S9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNX31Q8N9S9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX31Q8N9S9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNX31Q8N9S9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX31Q8N9S9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNX31Q8N9S9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SNX31Q8N9S9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX31Q8N9S9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX31Q8N9S9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SNX31Q8N9S9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SNX31Q8N9S9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX31Q8N9S9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SNX31Q8N9S9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SNX31Q8N9S9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SNX31Q8N9S9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SNX31Q8N9S9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX31Q8N9S9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX31Q8N9S9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SNX31Q8N9S9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX31Q8N9S9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX31Q8N9S9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX31Q8N9S9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX31Q8N9S9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX31Q8N9S9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX31Q8N9S9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX31Q8N9S9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX31Q8N9S9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX31Q8N9S9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX31Q8N9S9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX31Q8N9S9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX31Q8N9S9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX31Q8N9S9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX31Q8N9S9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX31Q8N9S9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX31Q8N9S9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX31Q8N9S9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX31Q8N9S9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX31Q8N9S9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX31Q8N9S9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX31Q8N9S9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX31Q8N9S9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX31Q8N9S9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX31Q8N9S9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX31Q8N9S9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX31Q8N9S9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX31Q8N9S9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX31Q8N9S9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX31Q8N9S9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX31Q8N9S9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX31Q8N9S9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX31Q8N9S9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX31Q8N9S9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX31Q8N9S9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX31Q8N9S9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX31Q8N9S9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX31Q8N9S9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX31Q8N9S9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX31Q8N9S9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX31Q8N9S9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX31Q8N9S9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX31Q8N9S9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SNX31Q8N9S9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SNX31Q8N9S9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms