Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9S9

SNX31, Sorting nexin-31, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX31Q8N9S9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.82■■■□□ 2.85
SNX31Q8N9S9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SNX31Q8N9S9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
SNX31Q8N9S9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SNX31Q8N9S9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SNX31Q8N9S9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SNX31Q8N9S9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
SNX31Q8N9S9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SNX31Q8N9S9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SNX31Q8N9S9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SNX31Q8N9S9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SNX31Q8N9S9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SNX31Q8N9S9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SNX31Q8N9S9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SNX31Q8N9S9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
SNX31Q8N9S9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SNX31Q8N9S9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SNX31Q8N9S9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SNX31Q8N9S9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SNX31Q8N9S9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SNX31Q8N9S9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
SNX31Q8N9S9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SNX31Q8N9S9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SNX31Q8N9S9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
SNX31Q8N9S9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
SNX31Q8N9S9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
SNX31Q8N9S9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SNX31Q8N9S9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SNX31Q8N9S9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SNX31Q8N9S9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SNX31Q8N9S9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SNX31Q8N9S9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
SNX31Q8N9S9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
SNX31Q8N9S9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
SNX31Q8N9S9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SNX31Q8N9S9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SNX31Q8N9S9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SNX31Q8N9S9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNX31Q8N9S9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNX31Q8N9S9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNX31Q8N9S9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SNX31Q8N9S9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SNX31Q8N9S9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SNX31Q8N9S9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SNX31Q8N9S9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNX31Q8N9S9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SNX31Q8N9S9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNX31Q8N9S9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNX31Q8N9S9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNX31Q8N9S9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNX31Q8N9S9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNX31Q8N9S9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNX31Q8N9S9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNX31Q8N9S9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SNX31Q8N9S9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SNX31Q8N9S9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SNX31Q8N9S9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SNX31Q8N9S9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SNX31Q8N9S9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNX31Q8N9S9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNX31Q8N9S9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNX31Q8N9S9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNX31Q8N9S9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SNX31Q8N9S9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SNX31Q8N9S9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX31Q8N9S9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX31Q8N9S9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SNX31Q8N9S9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SNX31Q8N9S9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SNX31Q8N9S9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SNX31Q8N9S9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX31Q8N9S9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SNX31Q8N9S9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SNX31Q8N9S9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SNX31Q8N9S9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SNX31Q8N9S9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SNX31Q8N9S9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SNX31Q8N9S9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SNX31Q8N9S9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX31Q8N9S9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX31Q8N9S9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SNX31Q8N9S9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SNX31Q8N9S9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SNX31Q8N9S9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX31Q8N9S9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SNX31Q8N9S9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SNX31Q8N9S9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SNX31Q8N9S9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX31Q8N9S9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SNX31Q8N9S9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SNX31Q8N9S9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX31Q8N9S9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SNX31Q8N9S9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SNX31Q8N9S9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SNX31Q8N9S9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SNX31Q8N9S9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SNX31Q8N9S9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX31Q8N9S9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SNX31Q8N9S9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SNX31Q8N9S9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms