Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3S3

PHTF2, Putative homeodomain transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF2Q8N3S3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHTF2Q8N3S3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHTF2Q8N3S3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PHTF2Q8N3S3 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PHTF2Q8N3S3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHTF2Q8N3S3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHTF2Q8N3S3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHTF2Q8N3S3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PHTF2Q8N3S3 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PHTF2Q8N3S3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHTF2Q8N3S3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PHTF2Q8N3S3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHTF2Q8N3S3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PHTF2Q8N3S3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PHTF2Q8N3S3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHTF2Q8N3S3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PHTF2Q8N3S3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PHTF2Q8N3S3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PHTF2Q8N3S3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PHTF2Q8N3S3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PHTF2Q8N3S3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PHTF2Q8N3S3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PHTF2Q8N3S3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PHTF2Q8N3S3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PHTF2Q8N3S3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHTF2Q8N3S3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PHTF2Q8N3S3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHTF2Q8N3S3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PHTF2Q8N3S3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHTF2Q8N3S3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PHTF2Q8N3S3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PHTF2Q8N3S3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHTF2Q8N3S3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHTF2Q8N3S3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHTF2Q8N3S3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PHTF2Q8N3S3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PHTF2Q8N3S3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHTF2Q8N3S3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHTF2Q8N3S3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PHTF2Q8N3S3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHTF2Q8N3S3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHTF2Q8N3S3 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PHTF2Q8N3S3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHTF2Q8N3S3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHTF2Q8N3S3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHTF2Q8N3S3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHTF2Q8N3S3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PHTF2Q8N3S3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PHTF2Q8N3S3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHTF2Q8N3S3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PHTF2Q8N3S3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHTF2Q8N3S3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PHTF2Q8N3S3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHTF2Q8N3S3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PHTF2Q8N3S3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PHTF2Q8N3S3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHTF2Q8N3S3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PHTF2Q8N3S3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PHTF2Q8N3S3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PHTF2Q8N3S3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHTF2Q8N3S3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHTF2Q8N3S3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PHTF2Q8N3S3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PHTF2Q8N3S3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PHTF2Q8N3S3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PHTF2Q8N3S3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHTF2Q8N3S3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHTF2Q8N3S3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHTF2Q8N3S3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHTF2Q8N3S3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHTF2Q8N3S3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHTF2Q8N3S3 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PHTF2Q8N3S3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHTF2Q8N3S3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHTF2Q8N3S3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PHTF2Q8N3S3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHTF2Q8N3S3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHTF2Q8N3S3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHTF2Q8N3S3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PHTF2Q8N3S3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHTF2Q8N3S3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHTF2Q8N3S3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PHTF2Q8N3S3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHTF2Q8N3S3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHTF2Q8N3S3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PHTF2Q8N3S3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PHTF2Q8N3S3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PHTF2Q8N3S3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHTF2Q8N3S3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHTF2Q8N3S3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHTF2Q8N3S3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PHTF2Q8N3S3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHTF2Q8N3S3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PHTF2Q8N3S3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHTF2Q8N3S3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHTF2Q8N3S3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PHTF2Q8N3S3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHTF2Q8N3S3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHTF2Q8N3S3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PHTF2Q8N3S3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms