Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00269Q8N2A0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
LINC00269Q8N2A0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00269Q8N2A0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00269Q8N2A0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
LINC00269Q8N2A0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00269Q8N2A0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00269Q8N2A0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00269Q8N2A0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00269Q8N2A0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00269Q8N2A0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LINC00269Q8N2A0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LINC00269Q8N2A0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LINC00269Q8N2A0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00269Q8N2A0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00269Q8N2A0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LINC00269Q8N2A0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00269Q8N2A0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00269Q8N2A0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LINC00269Q8N2A0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00269Q8N2A0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LINC00269Q8N2A0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LINC00269Q8N2A0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00269Q8N2A0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LINC00269Q8N2A0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LINC00269Q8N2A0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00269Q8N2A0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LINC00269Q8N2A0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00269Q8N2A0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00269Q8N2A0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00269Q8N2A0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00269Q8N2A0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00269Q8N2A0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00269Q8N2A0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00269Q8N2A0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00269Q8N2A0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00269Q8N2A0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00269Q8N2A0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00269Q8N2A0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00269Q8N2A0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00269Q8N2A0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00269Q8N2A0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00269Q8N2A0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00269Q8N2A0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00269Q8N2A0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00269Q8N2A0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00269Q8N2A0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00269Q8N2A0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00269Q8N2A0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00269Q8N2A0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00269Q8N2A0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00269Q8N2A0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00269Q8N2A0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00269Q8N2A0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00269Q8N2A0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00269Q8N2A0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00269Q8N2A0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00269Q8N2A0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00269Q8N2A0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00269Q8N2A0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00269Q8N2A0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00269Q8N2A0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00269Q8N2A0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00269Q8N2A0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00269Q8N2A0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00269Q8N2A0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00269Q8N2A0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00269Q8N2A0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00269Q8N2A0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00269Q8N2A0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00269Q8N2A0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00269Q8N2A0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LINC00269Q8N2A0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00269Q8N2A0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00269Q8N2A0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00269Q8N2A0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LINC00269Q8N2A0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00269Q8N2A0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LINC00269Q8N2A0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00269Q8N2A0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00269Q8N2A0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00269Q8N2A0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00269Q8N2A0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LINC00269Q8N2A0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00269Q8N2A0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00269Q8N2A0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00269Q8N2A0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LINC00269Q8N2A0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LINC00269Q8N2A0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00269Q8N2A0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LINC00269Q8N2A0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00269Q8N2A0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00269Q8N2A0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00269Q8N2A0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00269Q8N2A0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LINC00269Q8N2A0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00269Q8N2A0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00269Q8N2A0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00269Q8N2A0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
LINC00269Q8N2A0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.4 ms