Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC29A4Q7RTT9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC29A4Q7RTT9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC29A4Q7RTT9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC29A4Q7RTT9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC29A4Q7RTT9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC29A4Q7RTT9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC29A4Q7RTT9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC29A4Q7RTT9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC29A4Q7RTT9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC29A4Q7RTT9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC29A4Q7RTT9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC29A4Q7RTT9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC29A4Q7RTT9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC29A4Q7RTT9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC29A4Q7RTT9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC29A4Q7RTT9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC29A4Q7RTT9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC29A4Q7RTT9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC29A4Q7RTT9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC29A4Q7RTT9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC29A4Q7RTT9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC29A4Q7RTT9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC29A4Q7RTT9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC29A4Q7RTT9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC29A4Q7RTT9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC29A4Q7RTT9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC29A4Q7RTT9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC29A4Q7RTT9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC29A4Q7RTT9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC29A4Q7RTT9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC29A4Q7RTT9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC29A4Q7RTT9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC29A4Q7RTT9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC29A4Q7RTT9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC29A4Q7RTT9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC29A4Q7RTT9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC29A4Q7RTT9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC29A4Q7RTT9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC29A4Q7RTT9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC29A4Q7RTT9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC29A4Q7RTT9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC29A4Q7RTT9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC29A4Q7RTT9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC29A4Q7RTT9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SLC29A4Q7RTT9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC29A4Q7RTT9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SLC29A4Q7RTT9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC29A4Q7RTT9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC29A4Q7RTT9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SLC29A4Q7RTT9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SLC29A4Q7RTT9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC29A4Q7RTT9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SLC29A4Q7RTT9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SLC29A4Q7RTT9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC29A4Q7RTT9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SLC29A4Q7RTT9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC29A4Q7RTT9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC29A4Q7RTT9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SLC29A4Q7RTT9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SLC29A4Q7RTT9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC29A4Q7RTT9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLC29A4Q7RTT9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC29A4Q7RTT9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC29A4Q7RTT9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLC29A4Q7RTT9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC29A4Q7RTT9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC29A4Q7RTT9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC29A4Q7RTT9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC29A4Q7RTT9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC29A4Q7RTT9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC29A4Q7RTT9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC29A4Q7RTT9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC29A4Q7RTT9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC29A4Q7RTT9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC29A4Q7RTT9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC29A4Q7RTT9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC29A4Q7RTT9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC29A4Q7RTT9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC29A4Q7RTT9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC29A4Q7RTT9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC29A4Q7RTT9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC29A4Q7RTT9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC29A4Q7RTT9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC29A4Q7RTT9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC29A4Q7RTT9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC29A4Q7RTT9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC29A4Q7RTT9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC29A4Q7RTT9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC29A4Q7RTT9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC29A4Q7RTT9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC29A4Q7RTT9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC29A4Q7RTT9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC29A4Q7RTT9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC29A4Q7RTT9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC29A4Q7RTT9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC29A4Q7RTT9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC29A4Q7RTT9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC29A4Q7RTT9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC29A4Q7RTT9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms