Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C16orf54Q6UWD8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C16orf54Q6UWD8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C16orf54Q6UWD8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
C16orf54Q6UWD8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C16orf54Q6UWD8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
C16orf54Q6UWD8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C16orf54Q6UWD8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
C16orf54Q6UWD8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
C16orf54Q6UWD8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
C16orf54Q6UWD8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
C16orf54Q6UWD8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C16orf54Q6UWD8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
C16orf54Q6UWD8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C16orf54Q6UWD8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C16orf54Q6UWD8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
C16orf54Q6UWD8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
C16orf54Q6UWD8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C16orf54Q6UWD8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C16orf54Q6UWD8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C16orf54Q6UWD8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
C16orf54Q6UWD8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
C16orf54Q6UWD8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
C16orf54Q6UWD8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C16orf54Q6UWD8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C16orf54Q6UWD8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
C16orf54Q6UWD8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C16orf54Q6UWD8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
C16orf54Q6UWD8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C16orf54Q6UWD8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C16orf54Q6UWD8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
C16orf54Q6UWD8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C16orf54Q6UWD8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
C16orf54Q6UWD8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
C16orf54Q6UWD8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
C16orf54Q6UWD8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
C16orf54Q6UWD8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C16orf54Q6UWD8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
C16orf54Q6UWD8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C16orf54Q6UWD8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C16orf54Q6UWD8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
C16orf54Q6UWD8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
C16orf54Q6UWD8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
C16orf54Q6UWD8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C16orf54Q6UWD8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C16orf54Q6UWD8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C16orf54Q6UWD8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C16orf54Q6UWD8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C16orf54Q6UWD8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C16orf54Q6UWD8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
C16orf54Q6UWD8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C16orf54Q6UWD8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C16orf54Q6UWD8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C16orf54Q6UWD8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C16orf54Q6UWD8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C16orf54Q6UWD8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C16orf54Q6UWD8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C16orf54Q6UWD8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C16orf54Q6UWD8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C16orf54Q6UWD8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C16orf54Q6UWD8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C16orf54Q6UWD8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C16orf54Q6UWD8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C16orf54Q6UWD8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C16orf54Q6UWD8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C16orf54Q6UWD8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C16orf54Q6UWD8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C16orf54Q6UWD8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
C16orf54Q6UWD8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
C16orf54Q6UWD8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C16orf54Q6UWD8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
C16orf54Q6UWD8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
C16orf54Q6UWD8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C16orf54Q6UWD8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
C16orf54Q6UWD8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
C16orf54Q6UWD8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C16orf54Q6UWD8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C16orf54Q6UWD8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C16orf54Q6UWD8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
C16orf54Q6UWD8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
C16orf54Q6UWD8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
C16orf54Q6UWD8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C16orf54Q6UWD8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
C16orf54Q6UWD8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
C16orf54Q6UWD8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
C16orf54Q6UWD8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
C16orf54Q6UWD8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
C16orf54Q6UWD8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
C16orf54Q6UWD8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C16orf54Q6UWD8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
C16orf54Q6UWD8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
C16orf54Q6UWD8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
C16orf54Q6UWD8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
C16orf54Q6UWD8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C16orf54Q6UWD8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
C16orf54Q6UWD8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
C16orf54Q6UWD8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C16orf54Q6UWD8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
C16orf54Q6UWD8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
C16orf54Q6UWD8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms