Protein–RNA interactions for Protein: Q6UUV7

CRTC3, CREB-regulated transcription coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTC3Q6UUV7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRTC3Q6UUV7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRTC3Q6UUV7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CRTC3Q6UUV7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CRTC3Q6UUV7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRTC3Q6UUV7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CRTC3Q6UUV7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRTC3Q6UUV7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRTC3Q6UUV7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CRTC3Q6UUV7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRTC3Q6UUV7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRTC3Q6UUV7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRTC3Q6UUV7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRTC3Q6UUV7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CRTC3Q6UUV7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRTC3Q6UUV7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRTC3Q6UUV7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRTC3Q6UUV7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRTC3Q6UUV7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRTC3Q6UUV7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRTC3Q6UUV7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRTC3Q6UUV7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRTC3Q6UUV7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CRTC3Q6UUV7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRTC3Q6UUV7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRTC3Q6UUV7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRTC3Q6UUV7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRTC3Q6UUV7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CRTC3Q6UUV7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CRTC3Q6UUV7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRTC3Q6UUV7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CRTC3Q6UUV7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRTC3Q6UUV7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRTC3Q6UUV7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CRTC3Q6UUV7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRTC3Q6UUV7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CRTC3Q6UUV7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRTC3Q6UUV7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRTC3Q6UUV7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CRTC3Q6UUV7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRTC3Q6UUV7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CRTC3Q6UUV7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CRTC3Q6UUV7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRTC3Q6UUV7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRTC3Q6UUV7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CRTC3Q6UUV7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CRTC3Q6UUV7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CRTC3Q6UUV7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CRTC3Q6UUV7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CRTC3Q6UUV7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRTC3Q6UUV7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRTC3Q6UUV7 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CRTC3Q6UUV7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CRTC3Q6UUV7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRTC3Q6UUV7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CRTC3Q6UUV7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CRTC3Q6UUV7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRTC3Q6UUV7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CRTC3Q6UUV7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRTC3Q6UUV7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CRTC3Q6UUV7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRTC3Q6UUV7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CRTC3Q6UUV7 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CRTC3Q6UUV7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRTC3Q6UUV7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CRTC3Q6UUV7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRTC3Q6UUV7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CRTC3Q6UUV7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRTC3Q6UUV7 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRTC3Q6UUV7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CRTC3Q6UUV7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRTC3Q6UUV7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRTC3Q6UUV7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRTC3Q6UUV7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CRTC3Q6UUV7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRTC3Q6UUV7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CRTC3Q6UUV7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRTC3Q6UUV7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRTC3Q6UUV7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRTC3Q6UUV7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CRTC3Q6UUV7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRTC3Q6UUV7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CRTC3Q6UUV7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CRTC3Q6UUV7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CRTC3Q6UUV7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CRTC3Q6UUV7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms