Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIZ9

TRAT1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAT1Q6PIZ9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAT1Q6PIZ9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAT1Q6PIZ9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRAT1Q6PIZ9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAT1Q6PIZ9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAT1Q6PIZ9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAT1Q6PIZ9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRAT1Q6PIZ9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAT1Q6PIZ9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAT1Q6PIZ9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRAT1Q6PIZ9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAT1Q6PIZ9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAT1Q6PIZ9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRAT1Q6PIZ9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRAT1Q6PIZ9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAT1Q6PIZ9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAT1Q6PIZ9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAT1Q6PIZ9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAT1Q6PIZ9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAT1Q6PIZ9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAT1Q6PIZ9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAT1Q6PIZ9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAT1Q6PIZ9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAT1Q6PIZ9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAT1Q6PIZ9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAT1Q6PIZ9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAT1Q6PIZ9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAT1Q6PIZ9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAT1Q6PIZ9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAT1Q6PIZ9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAT1Q6PIZ9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAT1Q6PIZ9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAT1Q6PIZ9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAT1Q6PIZ9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAT1Q6PIZ9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAT1Q6PIZ9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAT1Q6PIZ9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAT1Q6PIZ9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAT1Q6PIZ9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAT1Q6PIZ9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAT1Q6PIZ9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAT1Q6PIZ9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAT1Q6PIZ9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAT1Q6PIZ9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAT1Q6PIZ9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAT1Q6PIZ9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAT1Q6PIZ9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAT1Q6PIZ9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAT1Q6PIZ9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAT1Q6PIZ9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAT1Q6PIZ9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAT1Q6PIZ9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAT1Q6PIZ9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAT1Q6PIZ9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
TRAT1Q6PIZ9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAT1Q6PIZ9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAT1Q6PIZ9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAT1Q6PIZ9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAT1Q6PIZ9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAT1Q6PIZ9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAT1Q6PIZ9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAT1Q6PIZ9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAT1Q6PIZ9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAT1Q6PIZ9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAT1Q6PIZ9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAT1Q6PIZ9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAT1Q6PIZ9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAT1Q6PIZ9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAT1Q6PIZ9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAT1Q6PIZ9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAT1Q6PIZ9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAT1Q6PIZ9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAT1Q6PIZ9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAT1Q6PIZ9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAT1Q6PIZ9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAT1Q6PIZ9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAT1Q6PIZ9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAT1Q6PIZ9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAT1Q6PIZ9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAT1Q6PIZ9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAT1Q6PIZ9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAT1Q6PIZ9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRAT1Q6PIZ9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAT1Q6PIZ9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAT1Q6PIZ9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAT1Q6PIZ9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAT1Q6PIZ9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAT1Q6PIZ9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAT1Q6PIZ9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAT1Q6PIZ9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAT1Q6PIZ9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAT1Q6PIZ9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAT1Q6PIZ9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRAT1Q6PIZ9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAT1Q6PIZ9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAT1Q6PIZ9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAT1Q6PIZ9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAT1Q6PIZ9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAT1Q6PIZ9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAT1Q6PIZ9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms