Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO42Q6P3S6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO42Q6P3S6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXO42Q6P3S6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FBXO42Q6P3S6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FBXO42Q6P3S6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO42Q6P3S6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO42Q6P3S6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FBXO42Q6P3S6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FBXO42Q6P3S6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXO42Q6P3S6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXO42Q6P3S6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXO42Q6P3S6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXO42Q6P3S6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FBXO42Q6P3S6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO42Q6P3S6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO42Q6P3S6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FBXO42Q6P3S6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO42Q6P3S6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO42Q6P3S6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FBXO42Q6P3S6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO42Q6P3S6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO42Q6P3S6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FBXO42Q6P3S6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
FBXO42Q6P3S6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO42Q6P3S6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FBXO42Q6P3S6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FBXO42Q6P3S6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FBXO42Q6P3S6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO42Q6P3S6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO42Q6P3S6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO42Q6P3S6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FBXO42Q6P3S6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO42Q6P3S6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FBXO42Q6P3S6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FBXO42Q6P3S6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO42Q6P3S6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FBXO42Q6P3S6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FBXO42Q6P3S6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FBXO42Q6P3S6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO42Q6P3S6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FBXO42Q6P3S6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FBXO42Q6P3S6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO42Q6P3S6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO42Q6P3S6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO42Q6P3S6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FBXO42Q6P3S6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO42Q6P3S6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FBXO42Q6P3S6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO42Q6P3S6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FBXO42Q6P3S6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
FBXO42Q6P3S6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO42Q6P3S6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FBXO42Q6P3S6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FBXO42Q6P3S6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO42Q6P3S6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO42Q6P3S6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO42Q6P3S6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO42Q6P3S6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FBXO42Q6P3S6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO42Q6P3S6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO42Q6P3S6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FBXO42Q6P3S6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FBXO42Q6P3S6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FBXO42Q6P3S6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXO42Q6P3S6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXO42Q6P3S6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
FBXO42Q6P3S6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO42Q6P3S6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO42Q6P3S6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO42Q6P3S6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO42Q6P3S6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
FBXO42Q6P3S6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO42Q6P3S6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
FBXO42Q6P3S6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO42Q6P3S6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
FBXO42Q6P3S6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FBXO42Q6P3S6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms