Protein–RNA interactions for Protein: Q6NYC1

JMJD6, Bifunctional arginine demethylase and lysyl-hydroxylase JMJD6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD6Q6NYC1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
JMJD6Q6NYC1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
JMJD6Q6NYC1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
JMJD6Q6NYC1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
JMJD6Q6NYC1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
JMJD6Q6NYC1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
JMJD6Q6NYC1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
JMJD6Q6NYC1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
JMJD6Q6NYC1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
JMJD6Q6NYC1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
JMJD6Q6NYC1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
JMJD6Q6NYC1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
JMJD6Q6NYC1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
JMJD6Q6NYC1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
JMJD6Q6NYC1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
JMJD6Q6NYC1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
JMJD6Q6NYC1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
JMJD6Q6NYC1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
JMJD6Q6NYC1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
JMJD6Q6NYC1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
JMJD6Q6NYC1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
JMJD6Q6NYC1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
JMJD6Q6NYC1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
JMJD6Q6NYC1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
JMJD6Q6NYC1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
JMJD6Q6NYC1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
JMJD6Q6NYC1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
JMJD6Q6NYC1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
JMJD6Q6NYC1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
JMJD6Q6NYC1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
JMJD6Q6NYC1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
JMJD6Q6NYC1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
JMJD6Q6NYC1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
JMJD6Q6NYC1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JMJD6Q6NYC1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
JMJD6Q6NYC1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
JMJD6Q6NYC1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
JMJD6Q6NYC1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
JMJD6Q6NYC1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
JMJD6Q6NYC1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
JMJD6Q6NYC1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
JMJD6Q6NYC1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
JMJD6Q6NYC1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
JMJD6Q6NYC1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
JMJD6Q6NYC1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
JMJD6Q6NYC1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
JMJD6Q6NYC1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
JMJD6Q6NYC1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
JMJD6Q6NYC1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
JMJD6Q6NYC1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
JMJD6Q6NYC1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
JMJD6Q6NYC1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
JMJD6Q6NYC1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
JMJD6Q6NYC1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
JMJD6Q6NYC1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
JMJD6Q6NYC1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
JMJD6Q6NYC1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
JMJD6Q6NYC1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
JMJD6Q6NYC1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
JMJD6Q6NYC1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
JMJD6Q6NYC1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
JMJD6Q6NYC1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
JMJD6Q6NYC1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
JMJD6Q6NYC1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
JMJD6Q6NYC1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
JMJD6Q6NYC1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
JMJD6Q6NYC1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
JMJD6Q6NYC1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
JMJD6Q6NYC1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
JMJD6Q6NYC1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
JMJD6Q6NYC1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
JMJD6Q6NYC1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
JMJD6Q6NYC1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
JMJD6Q6NYC1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
JMJD6Q6NYC1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
JMJD6Q6NYC1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
JMJD6Q6NYC1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
JMJD6Q6NYC1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms