Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
RCSD1Q6JBY9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32■■■□□ 2.71
RCSD1Q6JBY9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RCSD1Q6JBY9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RCSD1Q6JBY9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RCSD1Q6JBY9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RCSD1Q6JBY9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
RCSD1Q6JBY9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
RCSD1Q6JBY9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RCSD1Q6JBY9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
RCSD1Q6JBY9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RCSD1Q6JBY9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
RCSD1Q6JBY9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RCSD1Q6JBY9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
RCSD1Q6JBY9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RCSD1Q6JBY9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
RCSD1Q6JBY9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
RCSD1Q6JBY9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
RCSD1Q6JBY9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RCSD1Q6JBY9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
RCSD1Q6JBY9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
RCSD1Q6JBY9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
RCSD1Q6JBY9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
RCSD1Q6JBY9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
RCSD1Q6JBY9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
RCSD1Q6JBY9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
RCSD1Q6JBY9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
RCSD1Q6JBY9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
RCSD1Q6JBY9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
RCSD1Q6JBY9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
RCSD1Q6JBY9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
RCSD1Q6JBY9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
RCSD1Q6JBY9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RCSD1Q6JBY9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RCSD1Q6JBY9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
RCSD1Q6JBY9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
RCSD1Q6JBY9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.74■■■□□ 2.67
RCSD1Q6JBY9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
RCSD1Q6JBY9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
RCSD1Q6JBY9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RCSD1Q6JBY9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RCSD1Q6JBY9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RCSD1Q6JBY9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RCSD1Q6JBY9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
RCSD1Q6JBY9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RCSD1Q6JBY9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RCSD1Q6JBY9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RCSD1Q6JBY9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RCSD1Q6JBY9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
RCSD1Q6JBY9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RCSD1Q6JBY9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RCSD1Q6JBY9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RCSD1Q6JBY9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RCSD1Q6JBY9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RCSD1Q6JBY9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
RCSD1Q6JBY9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RCSD1Q6JBY9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
RCSD1Q6JBY9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
RCSD1Q6JBY9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
RCSD1Q6JBY9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RCSD1Q6JBY9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
RCSD1Q6JBY9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RCSD1Q6JBY9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
RCSD1Q6JBY9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
RCSD1Q6JBY9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
RCSD1Q6JBY9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RCSD1Q6JBY9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
RCSD1Q6JBY9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
RCSD1Q6JBY9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
RCSD1Q6JBY9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
RCSD1Q6JBY9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RCSD1Q6JBY9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RCSD1Q6JBY9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
RCSD1Q6JBY9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RCSD1Q6JBY9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RCSD1Q6JBY9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
RCSD1Q6JBY9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
RCSD1Q6JBY9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
RCSD1Q6JBY9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
RCSD1Q6JBY9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
RCSD1Q6JBY9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RCSD1Q6JBY9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
RCSD1Q6JBY9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RCSD1Q6JBY9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RCSD1Q6JBY9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RCSD1Q6JBY9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
RCSD1Q6JBY9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
RCSD1Q6JBY9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RCSD1Q6JBY9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
RCSD1Q6JBY9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
RCSD1Q6JBY9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RCSD1Q6JBY9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
RCSD1Q6JBY9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
RCSD1Q6JBY9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
RCSD1Q6JBY9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
RCSD1Q6JBY9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
RCSD1Q6JBY9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
RCSD1Q6JBY9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RCSD1Q6JBY9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.42■■■□□ 2.62
RCSD1Q6JBY9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms