Protein–RNA interactions for Protein: Q5Y7H0

HLA-DQA1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DQA1Q5Y7H0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DQA1Q5Y7H0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DQA1Q5Y7H0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-DQA1Q5Y7H0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DQA1Q5Y7H0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DQA1Q5Y7H0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-DQA1Q5Y7H0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-DQA1Q5Y7H0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
HLA-DQA1Q5Y7H0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HLA-DQA1Q5Y7H0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HLA-DQA1Q5Y7H0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-DQA1Q5Y7H0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-DQA1Q5Y7H0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HLA-DQA1Q5Y7H0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DQA1Q5Y7H0 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DQA1Q5Y7H0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HLA-DQA1Q5Y7H0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-DQA1Q5Y7H0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HLA-DQA1Q5Y7H0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HLA-DQA1Q5Y7H0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DQA1Q5Y7H0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HLA-DQA1Q5Y7H0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HLA-DQA1Q5Y7H0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HLA-DQA1Q5Y7H0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-DQA1Q5Y7H0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-DQA1Q5Y7H0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HLA-DQA1Q5Y7H0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HLA-DQA1Q5Y7H0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HLA-DQA1Q5Y7H0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-DQA1Q5Y7H0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HLA-DQA1Q5Y7H0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-DQA1Q5Y7H0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-DQA1Q5Y7H0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HLA-DQA1Q5Y7H0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DQA1Q5Y7H0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DQA1Q5Y7H0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DQA1Q5Y7H0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HLA-DQA1Q5Y7H0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DQA1Q5Y7H0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HLA-DQA1Q5Y7H0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HLA-DQA1Q5Y7H0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-DQA1Q5Y7H0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HLA-DQA1Q5Y7H0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DQA1Q5Y7H0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DQA1Q5Y7H0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HLA-DQA1Q5Y7H0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DQA1Q5Y7H0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DQA1Q5Y7H0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HLA-DQA1Q5Y7H0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DQA1Q5Y7H0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HLA-DQA1Q5Y7H0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DQA1Q5Y7H0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DQA1Q5Y7H0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HLA-DQA1Q5Y7H0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DQA1Q5Y7H0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DQA1Q5Y7H0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HLA-DQA1Q5Y7H0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DQA1Q5Y7H0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DQA1Q5Y7H0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DQA1Q5Y7H0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HLA-DQA1Q5Y7H0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DQA1Q5Y7H0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DQA1Q5Y7H0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HLA-DQA1Q5Y7H0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HLA-DQA1Q5Y7H0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DQA1Q5Y7H0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DQA1Q5Y7H0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HLA-DQA1Q5Y7H0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DQA1Q5Y7H0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DQA1Q5Y7H0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DQA1Q5Y7H0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DQA1Q5Y7H0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HLA-DQA1Q5Y7H0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DQA1Q5Y7H0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DQA1Q5Y7H0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HLA-DQA1Q5Y7H0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DQA1Q5Y7H0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HLA-DQA1Q5Y7H0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HLA-DQA1Q5Y7H0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HLA-DQA1Q5Y7H0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DQA1Q5Y7H0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DQA1Q5Y7H0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HLA-DQA1Q5Y7H0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DQA1Q5Y7H0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HLA-DQA1Q5Y7H0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DQA1Q5Y7H0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DQA1Q5Y7H0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HLA-DQA1Q5Y7H0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HLA-DQA1Q5Y7H0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DQA1Q5Y7H0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HLA-DQA1Q5Y7H0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DQA1Q5Y7H0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms