Protein–RNA interactions for Protein: Q5T4D3

TMTC4, Transmembrane and TPR repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMTC4Q5T4D3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMTC4Q5T4D3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMTC4Q5T4D3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMTC4Q5T4D3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TMTC4Q5T4D3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TMTC4Q5T4D3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TMTC4Q5T4D3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TMTC4Q5T4D3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TMTC4Q5T4D3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TMTC4Q5T4D3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMTC4Q5T4D3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TMTC4Q5T4D3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMTC4Q5T4D3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMTC4Q5T4D3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMTC4Q5T4D3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TMTC4Q5T4D3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TMTC4Q5T4D3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TMTC4Q5T4D3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TMTC4Q5T4D3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMTC4Q5T4D3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TMTC4Q5T4D3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMTC4Q5T4D3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMTC4Q5T4D3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMTC4Q5T4D3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMTC4Q5T4D3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMTC4Q5T4D3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMTC4Q5T4D3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMTC4Q5T4D3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMTC4Q5T4D3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TMTC4Q5T4D3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TMTC4Q5T4D3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMTC4Q5T4D3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMTC4Q5T4D3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMTC4Q5T4D3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMTC4Q5T4D3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMTC4Q5T4D3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMTC4Q5T4D3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMTC4Q5T4D3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMTC4Q5T4D3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMTC4Q5T4D3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMTC4Q5T4D3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMTC4Q5T4D3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMTC4Q5T4D3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMTC4Q5T4D3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMTC4Q5T4D3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMTC4Q5T4D3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMTC4Q5T4D3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMTC4Q5T4D3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMTC4Q5T4D3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMTC4Q5T4D3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMTC4Q5T4D3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMTC4Q5T4D3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMTC4Q5T4D3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMTC4Q5T4D3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMTC4Q5T4D3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMTC4Q5T4D3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMTC4Q5T4D3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMTC4Q5T4D3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMTC4Q5T4D3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMTC4Q5T4D3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMTC4Q5T4D3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMTC4Q5T4D3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMTC4Q5T4D3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMTC4Q5T4D3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMTC4Q5T4D3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMTC4Q5T4D3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMTC4Q5T4D3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMTC4Q5T4D3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMTC4Q5T4D3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMTC4Q5T4D3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMTC4Q5T4D3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMTC4Q5T4D3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TMTC4Q5T4D3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMTC4Q5T4D3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMTC4Q5T4D3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TMTC4Q5T4D3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TMTC4Q5T4D3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMTC4Q5T4D3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMTC4Q5T4D3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMTC4Q5T4D3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMTC4Q5T4D3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMTC4Q5T4D3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMTC4Q5T4D3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMTC4Q5T4D3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TMTC4Q5T4D3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMTC4Q5T4D3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMTC4Q5T4D3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMTC4Q5T4D3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMTC4Q5T4D3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMTC4Q5T4D3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMTC4Q5T4D3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMTC4Q5T4D3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMTC4Q5T4D3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMTC4Q5T4D3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMTC4Q5T4D3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMTC4Q5T4D3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMTC4Q5T4D3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMTC4Q5T4D3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TMTC4Q5T4D3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TMTC4Q5T4D3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms