Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUX0

SPIN3, Spindlin-3, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3Q5JUX0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIN3Q5JUX0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIN3Q5JUX0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPIN3Q5JUX0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPIN3Q5JUX0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIN3Q5JUX0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPIN3Q5JUX0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SPIN3Q5JUX0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIN3Q5JUX0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIN3Q5JUX0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SPIN3Q5JUX0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPIN3Q5JUX0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SPIN3Q5JUX0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SPIN3Q5JUX0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SPIN3Q5JUX0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIN3Q5JUX0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIN3Q5JUX0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SPIN3Q5JUX0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIN3Q5JUX0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIN3Q5JUX0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SPIN3Q5JUX0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIN3Q5JUX0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SPIN3Q5JUX0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIN3Q5JUX0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIN3Q5JUX0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SPIN3Q5JUX0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIN3Q5JUX0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SPIN3Q5JUX0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SPIN3Q5JUX0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SPIN3Q5JUX0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPIN3Q5JUX0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPIN3Q5JUX0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SPIN3Q5JUX0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPIN3Q5JUX0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SPIN3Q5JUX0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SPIN3Q5JUX0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SPIN3Q5JUX0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIN3Q5JUX0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIN3Q5JUX0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SPIN3Q5JUX0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIN3Q5JUX0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SPIN3Q5JUX0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIN3Q5JUX0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SPIN3Q5JUX0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SPIN3Q5JUX0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SPIN3Q5JUX0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPIN3Q5JUX0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPIN3Q5JUX0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SPIN3Q5JUX0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SPIN3Q5JUX0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPIN3Q5JUX0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SPIN3Q5JUX0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SPIN3Q5JUX0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPIN3Q5JUX0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPIN3Q5JUX0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPIN3Q5JUX0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPIN3Q5JUX0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPIN3Q5JUX0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPIN3Q5JUX0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPIN3Q5JUX0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPIN3Q5JUX0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPIN3Q5JUX0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPIN3Q5JUX0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIN3Q5JUX0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIN3Q5JUX0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPIN3Q5JUX0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIN3Q5JUX0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIN3Q5JUX0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIN3Q5JUX0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIN3Q5JUX0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPIN3Q5JUX0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPIN3Q5JUX0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIN3Q5JUX0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPIN3Q5JUX0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPIN3Q5JUX0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIN3Q5JUX0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPIN3Q5JUX0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIN3Q5JUX0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SPIN3Q5JUX0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIN3Q5JUX0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIN3Q5JUX0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPIN3Q5JUX0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SPIN3Q5JUX0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIN3Q5JUX0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIN3Q5JUX0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPIN3Q5JUX0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIN3Q5JUX0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIN3Q5JUX0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SPIN3Q5JUX0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIN3Q5JUX0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIN3Q5JUX0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPIN3Q5JUX0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIN3Q5JUX0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIN3Q5JUX0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIN3Q5JUX0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIN3Q5JUX0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIN3Q5JUX0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIN3Q5JUX0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIN3Q5JUX0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPIN3Q5JUX0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms