Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNNI3KQ59H18 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
TNNI3KQ59H18 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TNNI3KQ59H18 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
TNNI3KQ59H18 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
TNNI3KQ59H18 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
TNNI3KQ59H18 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
TNNI3KQ59H18 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNNI3KQ59H18 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TNNI3KQ59H18 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNNI3KQ59H18 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TNNI3KQ59H18 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNNI3KQ59H18 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TNNI3KQ59H18 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
TNNI3KQ59H18 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TNNI3KQ59H18 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TNNI3KQ59H18 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TNNI3KQ59H18 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TNNI3KQ59H18 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TNNI3KQ59H18 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNNI3KQ59H18 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNNI3KQ59H18 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TNNI3KQ59H18 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TNNI3KQ59H18 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TNNI3KQ59H18 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
TNNI3KQ59H18 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TNNI3KQ59H18 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
TNNI3KQ59H18 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
TNNI3KQ59H18 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
TNNI3KQ59H18 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
TNNI3KQ59H18 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
TNNI3KQ59H18 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TNNI3KQ59H18 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TNNI3KQ59H18 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
TNNI3KQ59H18 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
TNNI3KQ59H18 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNNI3KQ59H18 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TNNI3KQ59H18 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNNI3KQ59H18 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TNNI3KQ59H18 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
TNNI3KQ59H18 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
TNNI3KQ59H18 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
TNNI3KQ59H18 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TNNI3KQ59H18 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNNI3KQ59H18 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TNNI3KQ59H18 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
TNNI3KQ59H18 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
TNNI3KQ59H18 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNNI3KQ59H18 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
TNNI3KQ59H18 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TNNI3KQ59H18 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNNI3KQ59H18 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNNI3KQ59H18 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
TNNI3KQ59H18 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
TNNI3KQ59H18 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
TNNI3KQ59H18 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNNI3KQ59H18 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNNI3KQ59H18 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNNI3KQ59H18 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNNI3KQ59H18 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
TNNI3KQ59H18 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
TNNI3KQ59H18 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TNNI3KQ59H18 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TNNI3KQ59H18 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
TNNI3KQ59H18 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
TNNI3KQ59H18 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TNNI3KQ59H18 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
TNNI3KQ59H18 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
TNNI3KQ59H18 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
TNNI3KQ59H18 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TNNI3KQ59H18 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TNNI3KQ59H18 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TNNI3KQ59H18 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
TNNI3KQ59H18 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
TNNI3KQ59H18 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
TNNI3KQ59H18 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
TNNI3KQ59H18 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TNNI3KQ59H18 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TNNI3KQ59H18 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TNNI3KQ59H18 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
TNNI3KQ59H18 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TNNI3KQ59H18 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
TNNI3KQ59H18 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNNI3KQ59H18 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNNI3KQ59H18 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNNI3KQ59H18 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNNI3KQ59H18 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNNI3KQ59H18 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
TNNI3KQ59H18 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
TNNI3KQ59H18 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
TNNI3KQ59H18 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
TNNI3KQ59H18 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TNNI3KQ59H18 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TNNI3KQ59H18 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
TNNI3KQ59H18 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNNI3KQ59H18 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNNI3KQ59H18 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
TNNI3KQ59H18 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
TNNI3KQ59H18 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
TNNI3KQ59H18 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms