Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXU2

PABPC1L, Polyadenylate-binding protein 1-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1LQ4VXU2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PABPC1LQ4VXU2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PABPC1LQ4VXU2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PABPC1LQ4VXU2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PABPC1LQ4VXU2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PABPC1LQ4VXU2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PABPC1LQ4VXU2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PABPC1LQ4VXU2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PABPC1LQ4VXU2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PABPC1LQ4VXU2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PABPC1LQ4VXU2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PABPC1LQ4VXU2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PABPC1LQ4VXU2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms