Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXU2

PABPC1L, Polyadenylate-binding protein 1-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1LQ4VXU2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PABPC1LQ4VXU2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PABPC1LQ4VXU2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PABPC1LQ4VXU2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PABPC1LQ4VXU2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PABPC1LQ4VXU2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PABPC1LQ4VXU2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PABPC1LQ4VXU2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PABPC1LQ4VXU2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PABPC1LQ4VXU2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PABPC1LQ4VXU2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PABPC1LQ4VXU2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PABPC1LQ4VXU2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PABPC1LQ4VXU2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PABPC1LQ4VXU2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PABPC1LQ4VXU2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PABPC1LQ4VXU2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PABPC1LQ4VXU2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PABPC1LQ4VXU2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms