Protein–RNA interactions for Protein: Q32NB8

PGS1, CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1Q32NB8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PGS1Q32NB8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGS1Q32NB8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGS1Q32NB8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PGS1Q32NB8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PGS1Q32NB8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PGS1Q32NB8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PGS1Q32NB8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGS1Q32NB8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PGS1Q32NB8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGS1Q32NB8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PGS1Q32NB8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGS1Q32NB8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGS1Q32NB8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PGS1Q32NB8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PGS1Q32NB8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGS1Q32NB8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGS1Q32NB8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGS1Q32NB8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGS1Q32NB8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGS1Q32NB8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGS1Q32NB8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGS1Q32NB8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGS1Q32NB8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGS1Q32NB8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGS1Q32NB8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGS1Q32NB8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGS1Q32NB8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGS1Q32NB8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGS1Q32NB8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PGS1Q32NB8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PGS1Q32NB8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGS1Q32NB8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGS1Q32NB8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGS1Q32NB8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGS1Q32NB8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGS1Q32NB8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGS1Q32NB8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGS1Q32NB8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGS1Q32NB8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGS1Q32NB8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGS1Q32NB8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGS1Q32NB8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGS1Q32NB8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGS1Q32NB8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGS1Q32NB8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PGS1Q32NB8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGS1Q32NB8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGS1Q32NB8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGS1Q32NB8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGS1Q32NB8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGS1Q32NB8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGS1Q32NB8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGS1Q32NB8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGS1Q32NB8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGS1Q32NB8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGS1Q32NB8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGS1Q32NB8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGS1Q32NB8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGS1Q32NB8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGS1Q32NB8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGS1Q32NB8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGS1Q32NB8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGS1Q32NB8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGS1Q32NB8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGS1Q32NB8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGS1Q32NB8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGS1Q32NB8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGS1Q32NB8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PGS1Q32NB8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGS1Q32NB8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGS1Q32NB8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGS1Q32NB8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGS1Q32NB8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PGS1Q32NB8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGS1Q32NB8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGS1Q32NB8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGS1Q32NB8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms