Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR1D2Q14995 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NR1D2Q14995 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR1D2Q14995 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NR1D2Q14995 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NR1D2Q14995 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NR1D2Q14995 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR1D2Q14995 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NR1D2Q14995 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NR1D2Q14995 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NR1D2Q14995 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NR1D2Q14995 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NR1D2Q14995 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NR1D2Q14995 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NR1D2Q14995 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NR1D2Q14995 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NR1D2Q14995 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR1D2Q14995 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR1D2Q14995 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR1D2Q14995 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NR1D2Q14995 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NR1D2Q14995 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms