Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NR1D2Q14995 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NR1D2Q14995 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NR1D2Q14995 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NR1D2Q14995 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NR1D2Q14995 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
NR1D2Q14995 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NR1D2Q14995 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
NR1D2Q14995 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NR1D2Q14995 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
NR1D2Q14995 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NR1D2Q14995 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NR1D2Q14995 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NR1D2Q14995 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NR1D2Q14995 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NR1D2Q14995 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NR1D2Q14995 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NR1D2Q14995 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
NR1D2Q14995 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
NR1D2Q14995 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
NR1D2Q14995 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NR1D2Q14995 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
NR1D2Q14995 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NR1D2Q14995 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NR1D2Q14995 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NR1D2Q14995 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NR1D2Q14995 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
NR1D2Q14995 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
NR1D2Q14995 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
NR1D2Q14995 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NR1D2Q14995 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NR1D2Q14995 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NR1D2Q14995 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NR1D2Q14995 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NR1D2Q14995 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NR1D2Q14995 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NR1D2Q14995 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NR1D2Q14995 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NR1D2Q14995 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
NR1D2Q14995 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NR1D2Q14995 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NR1D2Q14995 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NR1D2Q14995 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NR1D2Q14995 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NR1D2Q14995 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NR1D2Q14995 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NR1D2Q14995 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
NR1D2Q14995 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
NR1D2Q14995 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
NR1D2Q14995 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
NR1D2Q14995 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NR1D2Q14995 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
NR1D2Q14995 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NR1D2Q14995 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NR1D2Q14995 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NR1D2Q14995 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NR1D2Q14995 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NR1D2Q14995 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NR1D2Q14995 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NR1D2Q14995 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NR1D2Q14995 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NR1D2Q14995 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NR1D2Q14995 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NR1D2Q14995 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NR1D2Q14995 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NR1D2Q14995 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NR1D2Q14995 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NR1D2Q14995 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NR1D2Q14995 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NR1D2Q14995 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NR1D2Q14995 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NR1D2Q14995 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NR1D2Q14995 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NR1D2Q14995 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NR1D2Q14995 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NR1D2Q14995 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NR1D2Q14995 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NR1D2Q14995 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NR1D2Q14995 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NR1D2Q14995 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NR1D2Q14995 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NR1D2Q14995 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NR1D2Q14995 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NR1D2Q14995 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NR1D2Q14995 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NR1D2Q14995 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
NR1D2Q14995 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NR1D2Q14995 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NR1D2Q14995 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NR1D2Q14995 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NR1D2Q14995 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NR1D2Q14995 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NR1D2Q14995 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NR1D2Q14995 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NR1D2Q14995 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NR1D2Q14995 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NR1D2Q14995 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NR1D2Q14995 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NR1D2Q14995 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NR1D2Q14995 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
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