Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CHAF1AQ13111 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHAF1AQ13111 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CHAF1AQ13111 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHAF1AQ13111 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CHAF1AQ13111 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CHAF1AQ13111 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CHAF1AQ13111 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CHAF1AQ13111 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CHAF1AQ13111 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHAF1AQ13111 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CHAF1AQ13111 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHAF1AQ13111 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHAF1AQ13111 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CHAF1AQ13111 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHAF1AQ13111 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CHAF1AQ13111 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHAF1AQ13111 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHAF1AQ13111 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHAF1AQ13111 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CHAF1AQ13111 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHAF1AQ13111 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CHAF1AQ13111 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHAF1AQ13111 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHAF1AQ13111 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHAF1AQ13111 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHAF1AQ13111 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CHAF1AQ13111 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHAF1AQ13111 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHAF1AQ13111 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHAF1AQ13111 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CHAF1AQ13111 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CHAF1AQ13111 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CHAF1AQ13111 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CHAF1AQ13111 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHAF1AQ13111 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CHAF1AQ13111 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
CHAF1AQ13111 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CHAF1AQ13111 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CHAF1AQ13111 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CHAF1AQ13111 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CHAF1AQ13111 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
CHAF1AQ13111 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CHAF1AQ13111 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CHAF1AQ13111 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
CHAF1AQ13111 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CHAF1AQ13111 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CHAF1AQ13111 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
CHAF1AQ13111 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHAF1AQ13111 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CHAF1AQ13111 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CHAF1AQ13111 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
CHAF1AQ13111 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CHAF1AQ13111 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CHAF1AQ13111 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CHAF1AQ13111 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHAF1AQ13111 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHAF1AQ13111 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
CHAF1AQ13111 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHAF1AQ13111 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHAF1AQ13111 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
CHAF1AQ13111 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CHAF1AQ13111 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CHAF1AQ13111 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
CHAF1AQ13111 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms