Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BPTFQ12830 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BPTFQ12830 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BPTFQ12830 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BPTFQ12830 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BPTFQ12830 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BPTFQ12830 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BPTFQ12830 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BPTFQ12830 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BPTFQ12830 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BPTFQ12830 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
BPTFQ12830 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BPTFQ12830 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BPTFQ12830 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BPTFQ12830 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BPTFQ12830 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BPTFQ12830 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BPTFQ12830 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BPTFQ12830 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BPTFQ12830 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
BPTFQ12830 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
BPTFQ12830 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
BPTFQ12830 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
BPTFQ12830 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
BPTFQ12830 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
BPTFQ12830 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
BPTFQ12830 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
BPTFQ12830 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BPTFQ12830 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
BPTFQ12830 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BPTFQ12830 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
BPTFQ12830 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
BPTFQ12830 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
BPTFQ12830 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
BPTFQ12830 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BPTFQ12830 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
BPTFQ12830 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
BPTFQ12830 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
BPTFQ12830 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BPTFQ12830 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
BPTFQ12830 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
BPTFQ12830 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BPTFQ12830 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BPTFQ12830 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BPTFQ12830 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BPTFQ12830 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BPTFQ12830 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BPTFQ12830 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
BPTFQ12830 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BPTFQ12830 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BPTFQ12830 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BPTFQ12830 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BPTFQ12830 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BPTFQ12830 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BPTFQ12830 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BPTFQ12830 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BPTFQ12830 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BPTFQ12830 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BPTFQ12830 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BPTFQ12830 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BPTFQ12830 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BPTFQ12830 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BPTFQ12830 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BPTFQ12830 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BPTFQ12830 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BPTFQ12830 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BPTFQ12830 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BPTFQ12830 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BPTFQ12830 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BPTFQ12830 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BPTFQ12830 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BPTFQ12830 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BPTFQ12830 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BPTFQ12830 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BPTFQ12830 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BPTFQ12830 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BPTFQ12830 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
BPTFQ12830 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BPTFQ12830 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BPTFQ12830 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BPTFQ12830 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BPTFQ12830 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BPTFQ12830 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
BPTFQ12830 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BPTFQ12830 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BPTFQ12830 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BPTFQ12830 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BPTFQ12830 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BPTFQ12830 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BPTFQ12830 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BPTFQ12830 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
BPTFQ12830 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BPTFQ12830 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
BPTFQ12830 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BPTFQ12830 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
BPTFQ12830 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
BPTFQ12830 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BPTFQ12830 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BPTFQ12830 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BPTFQ12830 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
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