Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
BPTFQ12830 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
BPTFQ12830 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
BPTFQ12830 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
BPTFQ12830 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BPTFQ12830 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
BPTFQ12830 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
BPTFQ12830 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
BPTFQ12830 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
BPTFQ12830 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
BPTFQ12830 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
BPTFQ12830 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
BPTFQ12830 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
BPTFQ12830 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
BPTFQ12830 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
BPTFQ12830 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
BPTFQ12830 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
BPTFQ12830 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
BPTFQ12830 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
BPTFQ12830 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
BPTFQ12830 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
BPTFQ12830 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
BPTFQ12830 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
BPTFQ12830 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
BPTFQ12830 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
BPTFQ12830 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
BPTFQ12830 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
BPTFQ12830 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
BPTFQ12830 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
BPTFQ12830 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
BPTFQ12830 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
BPTFQ12830 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
BPTFQ12830 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
BPTFQ12830 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
BPTFQ12830 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
BPTFQ12830 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
BPTFQ12830 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
BPTFQ12830 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
BPTFQ12830 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
BPTFQ12830 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
BPTFQ12830 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
BPTFQ12830 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
BPTFQ12830 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
BPTFQ12830 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BPTFQ12830 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
BPTFQ12830 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
BPTFQ12830 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
BPTFQ12830 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
BPTFQ12830 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
BPTFQ12830 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BPTFQ12830 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
BPTFQ12830 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
BPTFQ12830 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
BPTFQ12830 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
BPTFQ12830 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
BPTFQ12830 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
BPTFQ12830 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
BPTFQ12830 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
BPTFQ12830 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
BPTFQ12830 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
BPTFQ12830 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
BPTFQ12830 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
BPTFQ12830 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
BPTFQ12830 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
BPTFQ12830 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
BPTFQ12830 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
BPTFQ12830 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BPTFQ12830 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
BPTFQ12830 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
BPTFQ12830 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BPTFQ12830 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
BPTFQ12830 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BPTFQ12830 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
BPTFQ12830 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
BPTFQ12830 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
BPTFQ12830 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
BPTFQ12830 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
BPTFQ12830 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
BPTFQ12830 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
BPTFQ12830 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BPTFQ12830 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BPTFQ12830 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BPTFQ12830 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BPTFQ12830 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BPTFQ12830 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BPTFQ12830 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BPTFQ12830 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BPTFQ12830 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BPTFQ12830 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BPTFQ12830 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BPTFQ12830 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BPTFQ12830 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BPTFQ12830 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BPTFQ12830 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BPTFQ12830 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BPTFQ12830 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
BPTFQ12830 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BPTFQ12830 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BPTFQ12830 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BPTFQ12830 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
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