Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXM1Q08050 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FOXM1Q08050 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXM1Q08050 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FOXM1Q08050 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXM1Q08050 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FOXM1Q08050 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXM1Q08050 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXM1Q08050 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FOXM1Q08050 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXM1Q08050 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FOXM1Q08050 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXM1Q08050 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FOXM1Q08050 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXM1Q08050 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXM1Q08050 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FOXM1Q08050 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXM1Q08050 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FOXM1Q08050 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
FOXM1Q08050 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
FOXM1Q08050 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXM1Q08050 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXM1Q08050 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXM1Q08050 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXM1Q08050 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXM1Q08050 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXM1Q08050 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FOXM1Q08050 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXM1Q08050 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXM1Q08050 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXM1Q08050 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXM1Q08050 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FOXM1Q08050 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXM1Q08050 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXM1Q08050 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FOXM1Q08050 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXM1Q08050 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FOXM1Q08050 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FOXM1Q08050 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FOXM1Q08050 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FOXM1Q08050 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXM1Q08050 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FOXM1Q08050 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FOXM1Q08050 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXM1Q08050 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FOXM1Q08050 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXM1Q08050 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXM1Q08050 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXM1Q08050 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXM1Q08050 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXM1Q08050 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXM1Q08050 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXM1Q08050 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXM1Q08050 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXM1Q08050 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXM1Q08050 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXM1Q08050 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXM1Q08050 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXM1Q08050 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXM1Q08050 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXM1Q08050 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXM1Q08050 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXM1Q08050 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXM1Q08050 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXM1Q08050 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXM1Q08050 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXM1Q08050 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXM1Q08050 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXM1Q08050 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXM1Q08050 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXM1Q08050 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXM1Q08050 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXM1Q08050 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXM1Q08050 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXM1Q08050 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXM1Q08050 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXM1Q08050 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXM1Q08050 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXM1Q08050 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXM1Q08050 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXM1Q08050 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXM1Q08050 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXM1Q08050 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXM1Q08050 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXM1Q08050 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXM1Q08050 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXM1Q08050 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXM1Q08050 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FOXM1Q08050 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXM1Q08050 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXM1Q08050 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXM1Q08050 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXM1Q08050 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXM1Q08050 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXM1Q08050 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXM1Q08050 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXM1Q08050 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXM1Q08050 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXM1Q08050 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXM1Q08050 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms