Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RELAQ04206 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RELAQ04206 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RELAQ04206 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RELAQ04206 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RELAQ04206 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RELAQ04206 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RELAQ04206 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RELAQ04206 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RELAQ04206 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RELAQ04206 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RELAQ04206 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RELAQ04206 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RELAQ04206 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RELAQ04206 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RELAQ04206 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RELAQ04206 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RELAQ04206 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RELAQ04206 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RELAQ04206 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RELAQ04206 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RELAQ04206 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RELAQ04206 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RELAQ04206 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RELAQ04206 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RELAQ04206 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RELAQ04206 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RELAQ04206 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RELAQ04206 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RELAQ04206 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RELAQ04206 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RELAQ04206 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RELAQ04206 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RELAQ04206 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RELAQ04206 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RELAQ04206 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RELAQ04206 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RELAQ04206 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RELAQ04206 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RELAQ04206 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RELAQ04206 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RELAQ04206 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RELAQ04206 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RELAQ04206 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RELAQ04206 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RELAQ04206 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RELAQ04206 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RELAQ04206 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RELAQ04206 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RELAQ04206 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RELAQ04206 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RELAQ04206 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RELAQ04206 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RELAQ04206 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RELAQ04206 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RELAQ04206 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RELAQ04206 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RELAQ04206 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RELAQ04206 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RELAQ04206 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RELAQ04206 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RELAQ04206 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RELAQ04206 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RELAQ04206 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RELAQ04206 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RELAQ04206 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RELAQ04206 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RELAQ04206 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RELAQ04206 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RELAQ04206 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RELAQ04206 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RELAQ04206 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RELAQ04206 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RELAQ04206 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RELAQ04206 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RELAQ04206 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RELAQ04206 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RELAQ04206 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RELAQ04206 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RELAQ04206 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RELAQ04206 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RELAQ04206 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RELAQ04206 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RELAQ04206 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RELAQ04206 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RELAQ04206 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RELAQ04206 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RELAQ04206 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RELAQ04206 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RELAQ04206 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RELAQ04206 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RELAQ04206 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RELAQ04206 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RELAQ04206 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RELAQ04206 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RELAQ04206 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RELAQ04206 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RELAQ04206 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RELAQ04206 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RELAQ04206 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms