Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC5Q00444 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC5Q00444 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC5Q00444 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC5Q00444 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC5Q00444 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXC5Q00444 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC5Q00444 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXC5Q00444 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXC5Q00444 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC5Q00444 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC5Q00444 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC5Q00444 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC5Q00444 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXC5Q00444 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXC5Q00444 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC5Q00444 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC5Q00444 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC5Q00444 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC5Q00444 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC5Q00444 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC5Q00444 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HOXC5Q00444 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HOXC5Q00444 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC5Q00444 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC5Q00444 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HOXC5Q00444 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HOXC5Q00444 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HOXC5Q00444 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HOXC5Q00444 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC5Q00444 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC5Q00444 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HOXC5Q00444 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC5Q00444 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC5Q00444 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC5Q00444 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HOXC5Q00444 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC5Q00444 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC5Q00444 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HOXC5Q00444 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC5Q00444 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC5Q00444 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HOXC5Q00444 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HOXC5Q00444 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC5Q00444 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC5Q00444 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HOXC5Q00444 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HOXC5Q00444 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HOXC5Q00444 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC5Q00444 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HOXC5Q00444 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC5Q00444 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC5Q00444 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC5Q00444 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HOXC5Q00444 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC5Q00444 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC5Q00444 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HOXC5Q00444 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HOXC5Q00444 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HOXC5Q00444 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC5Q00444 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC5Q00444 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HOXC5Q00444 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC5Q00444 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC5Q00444 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC5Q00444 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC5Q00444 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HOXC5Q00444 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC5Q00444 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC5Q00444 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC5Q00444 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HOXC5Q00444 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC5Q00444 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC5Q00444 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC5Q00444 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HOXC5Q00444 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HOXC5Q00444 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC5Q00444 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC5Q00444 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC5Q00444 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HOXC5Q00444 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC5Q00444 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC5Q00444 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HOXC5Q00444 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC5Q00444 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC5Q00444 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC5Q00444 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC5Q00444 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HOXC5Q00444 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC5Q00444 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HOXC5Q00444 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOXC5Q00444 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC5Q00444 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC5Q00444 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC5Q00444 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC5Q00444 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOXC5Q00444 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOXC5Q00444 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HOXC5Q00444 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOXC5Q00444 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms