Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HOXC5Q00444 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HOXC5Q00444 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
HOXC5Q00444 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HOXC5Q00444 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HOXC5Q00444 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HOXC5Q00444 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
HOXC5Q00444 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
HOXC5Q00444 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HOXC5Q00444 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
HOXC5Q00444 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXC5Q00444 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXC5Q00444 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXC5Q00444 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXC5Q00444 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXC5Q00444 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
HOXC5Q00444 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXC5Q00444 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXC5Q00444 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXC5Q00444 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXC5Q00444 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXC5Q00444 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
HOXC5Q00444 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HOXC5Q00444 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXC5Q00444 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXC5Q00444 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXC5Q00444 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXC5Q00444 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOXC5Q00444 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXC5Q00444 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HOXC5Q00444 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXC5Q00444 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXC5Q00444 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXC5Q00444 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXC5Q00444 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXC5Q00444 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXC5Q00444 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXC5Q00444 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXC5Q00444 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXC5Q00444 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXC5Q00444 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HOXC5Q00444 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXC5Q00444 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXC5Q00444 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXC5Q00444 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXC5Q00444 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXC5Q00444 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXC5Q00444 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXC5Q00444 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXC5Q00444 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXC5Q00444 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXC5Q00444 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXC5Q00444 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXC5Q00444 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXC5Q00444 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXC5Q00444 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXC5Q00444 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXC5Q00444 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXC5Q00444 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXC5Q00444 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXC5Q00444 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXC5Q00444 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXC5Q00444 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXC5Q00444 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXC5Q00444 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXC5Q00444 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HOXC5Q00444 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC5Q00444 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXC5Q00444 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXC5Q00444 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXC5Q00444 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC5Q00444 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXC5Q00444 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXC5Q00444 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXC5Q00444 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXC5Q00444 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXC5Q00444 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXC5Q00444 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HOXC5Q00444 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HOXC5Q00444 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HOXC5Q00444 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HOXC5Q00444 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HOXC5Q00444 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HOXC5Q00444 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HOXC5Q00444 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXC5Q00444 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HOXC5Q00444 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HOXC5Q00444 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HOXC5Q00444 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HOXC5Q00444 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HOXC5Q00444 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HOXC5Q00444 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HOXC5Q00444 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
HOXC5Q00444 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HOXC5Q00444 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
HOXC5Q00444 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HOXC5Q00444 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXC5Q00444 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXC5Q00444 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXC5Q00444 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms