Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MAT1AQ00266 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MAT1AQ00266 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MAT1AQ00266 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MAT1AQ00266 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MAT1AQ00266 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MAT1AQ00266 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAT1AQ00266 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAT1AQ00266 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAT1AQ00266 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MAT1AQ00266 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MAT1AQ00266 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAT1AQ00266 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAT1AQ00266 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAT1AQ00266 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAT1AQ00266 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAT1AQ00266 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAT1AQ00266 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAT1AQ00266 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAT1AQ00266 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAT1AQ00266 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAT1AQ00266 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAT1AQ00266 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAT1AQ00266 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAT1AQ00266 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAT1AQ00266 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAT1AQ00266 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAT1AQ00266 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAT1AQ00266 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAT1AQ00266 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAT1AQ00266 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAT1AQ00266 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAT1AQ00266 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAT1AQ00266 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MAT1AQ00266 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAT1AQ00266 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAT1AQ00266 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAT1AQ00266 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAT1AQ00266 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAT1AQ00266 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAT1AQ00266 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAT1AQ00266 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MAT1AQ00266 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAT1AQ00266 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAT1AQ00266 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAT1AQ00266 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MAT1AQ00266 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAT1AQ00266 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAT1AQ00266 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MAT1AQ00266 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAT1AQ00266 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAT1AQ00266 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MAT1AQ00266 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAT1AQ00266 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAT1AQ00266 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAT1AQ00266 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MAT1AQ00266 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
MAT1AQ00266 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAT1AQ00266 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAT1AQ00266 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MAT1AQ00266 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAT1AQ00266 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAT1AQ00266 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAT1AQ00266 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAT1AQ00266 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MAT1AQ00266 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MAT1AQ00266 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MAT1AQ00266 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MAT1AQ00266 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MAT1AQ00266 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAT1AQ00266 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAT1AQ00266 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MAT1AQ00266 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAT1AQ00266 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAT1AQ00266 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAT1AQ00266 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MAT1AQ00266 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAT1AQ00266 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAT1AQ00266 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAT1AQ00266 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAT1AQ00266 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAT1AQ00266 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MAT1AQ00266 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAT1AQ00266 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MAT1AQ00266 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MAT1AQ00266 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MAT1AQ00266 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAT1AQ00266 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MAT1AQ00266 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MAT1AQ00266 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAT1AQ00266 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAT1AQ00266 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAT1AQ00266 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAT1AQ00266 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAT1AQ00266 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAT1AQ00266 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAT1AQ00266 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAT1AQ00266 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAT1AQ00266 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAT1AQ00266 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms